Zestawy treści WoRMS są udostępniane, i mogą mieć osobne identyfikatory i własne strony główne/uruchamiające, jako „subregistry”, takie jak World List of Marine Acanthocephala, World List of Actiniaria, World Amphipoda Database, World Porifera Database, i tak dalej. Na grudzień 2018 roku istniało 60 takich subrejestrów taksonomicznych, w tym kilka będących obecnie w budowie. Druga kategoria podrejestrów obejmuje regionalne bazy danych gatunków, takie jak African Register of Marine Species, Belgian Register of Marine Species, etc., podczas gdy trzecia obejmuje podzbiory tematyczne, takie jak World Register of Deep-Sea species (WoRDSS), World Register of Introduced Marine Species (WRiMS), etc. We wszystkich tych przypadkach dane podstawowe są wprowadzane i przechowywane tylko raz jako część systemu danych WoRMS w celu ułatwienia konserwacji i spójności danych, i są ponownie wyświetlane w razie potrzeby w kontekście odpowiedniego podrejestru lub podrejestrów, do których mogą również należeć.

Niektóre podrejestry rozszerzają zawartość poza pierwotną „morską” koncepcję WoRMS poprzez włączenie taksonów słodkowodnych lub lądowych dla kompletności w wyznaczonym obszarze zainteresowania; takie rekordy mogą być wyłączone ze standardowego przeszukiwania WoRMS poprzez wybranie odpowiednich opcji w interfejsie wyszukiwania online.

.