Delmängder av WoRMS-innehållet görs tillgängliga, och kan ha separat märkning och egna startsidor, som ”delregister”, t.ex. World List of Marine Acanthocephala, World List of Actiniaria, World Amphipoda Database, World Porifera Database, och så vidare. I december 2018 fanns det 60 sådana taxonomiska underregister, inklusive ett antal som för närvarande är under uppbyggnad. En andra kategori av underregister omfattar regionala artdatabaser som African Register of Marine Species, Belgian Register of Marine Species osv. medan en tredje kategori omfattar tematiska undergrupper som World Register of Deep-Sea species (WoRDSS), World Register of Introduced Marine Species (WRiMS) osv. I alla dessa fall förs basdata in och lagras endast en gång som en del av WoRMS-datasystemet för att underlätta underhåll och datakonsistens, och visas på nytt vid behov i samband med det eller de relevanta delregister som de också kan tillhöra.

Vissa underregister utökar innehållet utöver det ursprungliga ”marina” konceptet i WoRMS genom att inkludera sötvattens- eller terrestra taxa för fullständighetens skull i det område som är av intresse för dem; sådana poster kan uteslutas från en standardsökning i WoRMS genom att välja lämpliga alternativ i gränssnittet för onlinesökning.