Przeprowadzka na Zachód

Kolejny punkt zwrotny dla Stanleya nastąpił dzięki innej fortunnej okoliczności. Gordon Sproul, prezydent Uniwersytetu Kalifornijskiego, szukał człowieka, który mógłby poprowadzić nowy wydział biochemii w Berkeley. On i Stanley spotkali się, gdy ich samoloty zostały uziemione przez mgłę, i w zasadzie zgodzili się na wspólną przyszłość. Częścią umowy było utworzenie przez kalifornijską Legislaturę osobnego laboratorium badawczego, Virus Laboratory. W 1948 roku Stanley przeniósł się do Berkeley, z powodzeniem obsadzając zarówno wydział biochemii, jak i Laboratorium Wirusów w ciągu następnych 5 lat.

Zainteresowanie Stanleya odwróciło się od wirusów roślinnych do ludzkich patogenów, zwłaszcza wirusa grypy. Podczas II wojny światowej jego głównym celem było opracowanie szczepionki przeciwko temu wirusowi. W Berkeley kontynuowano badania nad wirusami roślinnymi, bakteryjnymi i zwierzęcymi; największym zainteresowaniem Stanleya cieszyły się wirusy zwierzęce, z poliomyelitis jako punktem centralnym. W kolejnych latach jego zainteresowania zwróciły się bardziej w kierunku wirusów wywołujących nowotwory. Kilka z nich zostało opisanych jako wywołujące guzy u kurczaków lub królików, które przypominały ludzkie nowotwory złośliwe. Przekonanie, że wiele lub wszystkie nowotwory złośliwe mogą być spowodowane przez wirusy znalazł nowego zwolennika i proroka w Stanley. Ten aspekt jego kariery otrzymał ukoronowanie uznania, gdy służył jako prezydent Dziesiątego Międzynarodowego Kongresu Raka w 1970.

Stanley otrzymał wiele wyróżnień i nagród. Oprócz Nagrody Nobla w dziedzinie chemii w 1946 r., którą dzielił z Johnem Northropem i Jamesem Sumnerem, otrzymał Prezydencki Certyfikat Zasługi i Medal Franklina w 1948 r., nagrodę American Cancer Society w 1959 r. oraz kilkanaście doktoratów honoris causa. Stanley przeszedł na emeryturę jako dyrektor Virus Laboratory w 1969 roku. Zmarł w Salamance, w Hiszpanii, 15 czerwca 1971 r.

.