Articles

Structural basis of substrate binding in WsaF, a rhamnosyltransferase from Geobacillus stearothermophilus – University of St Andrews

TY – JOUR

T1 – Strukturalne podstawy wiązania substratów w WsaF, a rhamnosyltransferase from Geobacillus stearothermophilus

AU – Steiner, Kerstin

AU – Hageluken, Gregor

AU – Messner, Paul

AU – Schaeffer, Christina

AU – Naismith, James Henderson

PY – 2010/3/26

Y1 – 2010/3/26

N2 – Polimery węglowodanowe są ważne z medycznego i przemysłowego punktu widzenia. Warstwa S wielu organizmów Gram-dodatnich składa się z polimerów białkowych i węglowodanowych i tworzy prawie parakrystaliczny układ na powierzchni komórki. Układ ten jest ważny nie tylko dla bakterii, ale ma również potencjalne zastosowanie w produkcji ważnych z handlowego punktu widzenia polisacharydów i glikokoniugatów. Glikan glikoproteiny warstwy S z Geobacillus stearothermophilus NRS 2004/3a składa się głównie z powtarzających się jednostek trzech cukrów ramnozy połączonych wiązaniami alfa-1,3-, alfa-1,2- i beta-1,2-. Tworzenie wiązania beta-1,2 katalizowane jest przez enzym WsaF. Racjonalne wykorzystanie tego systemu utrudnia fakt, że WsaF i inne enzymy uczestnicz±ce w tym szlaku wykazuj± bardzo niewielk± homologię z innymi enzymami. Przedstawiamy strukturalną i biochemiczną charakterystykę WsaF, pierwszej tak scharakteryzowanej rhamnosylotransferazy. Prace strukturalne wspomagane były metodą redukcji entropii powierzchniowej. Enzym posiada dwie domeny, N-końcową, która wiąże akceptor (rosnący łańcuch ramnanu) oraz C-końcową, która wiąże substrat (dTDP-beta-L-ramnozę). Struktura WsaF związanego z dTDP i dTDP-beta-L-rahamnozą w połączeniu z analizą biochemiczną pozwala zidentyfikować reszty odpowiedzialne za katalizę i rozpoznawanie substratu. Zbudowali¶my i przetestowali¶my model rozpoznawania akceptora za pomoc± mutagenezy ukierunkowanej miejscowo. (C) 2010 Elsevier Ltd. All rights reserved.

AB – Polimery węglowodanowe są ważne z medycznego i przemysłowego punktu widzenia. Warstwa S wielu organizmów Gram-dodatnich składa się z polimerów białkowych i węglowodanowych i tworzy prawie parakrystaliczny układ na powierzchni komórki. Układ ten jest ważny nie tylko dla bakterii, ale ma również potencjalne zastosowanie w produkcji ważnych z handlowego punktu widzenia polisacharydów i glikokoniugatów. Glikan glikoproteiny warstwy S z Geobacillus stearothermophilus NRS 2004/3a składa się głównie z powtarzających się jednostek trzech cukrów ramnozy połączonych wiązaniami alfa-1,3-, alfa-1,2- i beta-1,2-. Tworzenie wiązania beta-1,2 katalizowane jest przez enzym WsaF. Racjonalne wykorzystanie tego systemu utrudnia fakt, że WsaF i inne enzymy uczestnicz±ce w tym szlaku wykazuj± bardzo niewielk± homologię z innymi enzymami. Przedstawiamy strukturalną i biochemiczną charakterystykę WsaF, pierwszej tak scharakteryzowanej rhamnosylotransferazy. Prace strukturalne wspomagane były metodą redukcji entropii powierzchniowej. Enzym posiada dwie domeny, N-końcową, która wiąże akceptor (rosnący łańcuch ramnanu) oraz C-końcową, która wiąże substrat (dTDP-beta-L-ramnozę). Struktura WsaF związanego z dTDP i dTDP-beta-L-rahamnozą w połączeniu z analizą biochemiczną pozwala zidentyfikować reszty odpowiedzialne za katalizę i rozpoznawanie substratu. Zbudowali¶my i przetestowali¶my model rozpoznawania akceptora za pomoc± mutagenezy ukierunkowanej miejscowo. (C) 2010 Elsevier Ltd. All rights reserved. Mannosyltreansferase pima

KW – Glycogen-Synthase

KW – Dane dyfrakcyjne

KW – Gene-cluster

KW -. Family GT4

KW – Glycosyltransferases

KW – Catalysis

KW – Sequence

UR – http://www.scopus.com/inward/record.url?scp=77349090654&partnerID=8YFLogxK

.