Structural basis of substrate binding in WsaF, a rhamnosyltransferase from Geobacillus stearothermophilus – University of St Andrews
TY – JOUR
T1 – Strukturalne podstawy wiązania substratów w WsaF, a rhamnosyltransferase from Geobacillus stearothermophilus
AU – Steiner, Kerstin
AU – Hageluken, Gregor
AU – Messner, Paul
AU – Schaeffer, Christina
AU – Naismith, James Henderson
PY – 2010/3/26
Y1 – 2010/3/26
N2 – Polimery węglowodanowe są ważne z medycznego i przemysłowego punktu widzenia. Warstwa S wielu organizmów Gram-dodatnich składa się z polimerów białkowych i węglowodanowych i tworzy prawie parakrystaliczny układ na powierzchni komórki. Układ ten jest ważny nie tylko dla bakterii, ale ma również potencjalne zastosowanie w produkcji ważnych z handlowego punktu widzenia polisacharydów i glikokoniugatów. Glikan glikoproteiny warstwy S z Geobacillus stearothermophilus NRS 2004/3a składa się głównie z powtarzających się jednostek trzech cukrów ramnozy połączonych wiązaniami alfa-1,3-, alfa-1,2- i beta-1,2-. Tworzenie wiązania beta-1,2 katalizowane jest przez enzym WsaF. Racjonalne wykorzystanie tego systemu utrudnia fakt, że WsaF i inne enzymy uczestnicz±ce w tym szlaku wykazuj± bardzo niewielk± homologię z innymi enzymami. Przedstawiamy strukturalną i biochemiczną charakterystykę WsaF, pierwszej tak scharakteryzowanej rhamnosylotransferazy. Prace strukturalne wspomagane były metodą redukcji entropii powierzchniowej. Enzym posiada dwie domeny, N-końcową, która wiąże akceptor (rosnący łańcuch ramnanu) oraz C-końcową, która wiąże substrat (dTDP-beta-L-ramnozę). Struktura WsaF związanego z dTDP i dTDP-beta-L-rahamnozą w połączeniu z analizą biochemiczną pozwala zidentyfikować reszty odpowiedzialne za katalizę i rozpoznawanie substratu. Zbudowali¶my i przetestowali¶my model rozpoznawania akceptora za pomoc± mutagenezy ukierunkowanej miejscowo. (C) 2010 Elsevier Ltd. All rights reserved.
AB – Polimery węglowodanowe są ważne z medycznego i przemysłowego punktu widzenia. Warstwa S wielu organizmów Gram-dodatnich składa się z polimerów białkowych i węglowodanowych i tworzy prawie parakrystaliczny układ na powierzchni komórki. Układ ten jest ważny nie tylko dla bakterii, ale ma również potencjalne zastosowanie w produkcji ważnych z handlowego punktu widzenia polisacharydów i glikokoniugatów. Glikan glikoproteiny warstwy S z Geobacillus stearothermophilus NRS 2004/3a składa się głównie z powtarzających się jednostek trzech cukrów ramnozy połączonych wiązaniami alfa-1,3-, alfa-1,2- i beta-1,2-. Tworzenie wiązania beta-1,2 katalizowane jest przez enzym WsaF. Racjonalne wykorzystanie tego systemu utrudnia fakt, że WsaF i inne enzymy uczestnicz±ce w tym szlaku wykazuj± bardzo niewielk± homologię z innymi enzymami. Przedstawiamy strukturalną i biochemiczną charakterystykę WsaF, pierwszej tak scharakteryzowanej rhamnosylotransferazy. Prace strukturalne wspomagane były metodą redukcji entropii powierzchniowej. Enzym posiada dwie domeny, N-końcową, która wiąże akceptor (rosnący łańcuch ramnanu) oraz C-końcową, która wiąże substrat (dTDP-beta-L-ramnozę). Struktura WsaF związanego z dTDP i dTDP-beta-L-rahamnozą w połączeniu z analizą biochemiczną pozwala zidentyfikować reszty odpowiedzialne za katalizę i rozpoznawanie substratu. Zbudowali¶my i przetestowali¶my model rozpoznawania akceptora za pomoc± mutagenezy ukierunkowanej miejscowo. (C) 2010 Elsevier Ltd. All rights reserved. Mannosyltreansferase pima
KW – Glycogen-Synthase
KW – Dane dyfrakcyjne
KW – Gene-cluster
KW -. Family GT4
KW – Glycosyltransferases
KW – Catalysis
KW – Sequence
UR – http://www.scopus.com/inward/record.url?scp=77349090654&partnerID=8YFLogxK
.