Jenner urodził się w Chatham 30 stycznia 1815, i wykształcony w University College London. Został członkiem Royal College of Surgeons of England (M.R.C.S.) w 1837 roku, Fellow of the Royal College of Physicians (F.R.C.P.) w 1852 roku, a w 1844 roku wziął London M.D.

W 1847 roku rozpoczął w londyńskim Fever Hospital badania przypadków ciągłej gorączki, które pozwoliły mu w końcu dokonać rozróżnienia między tyfusem a tyfusem, na którym głównie spoczywa jego reputacja jako patologa, publikując książkę „On the Identity or Non-Identity of Typhoid and Typhus Fever” w 1850 roku. W 1849 roku został mianowany profesorem anatomii patologicznej w University College, a także asystent lekarza do University College Hospital, gdzie następnie został lekarzem (1854-1876) i lekarza konsultanta (1879), oprócz posiadania podobnych nominacji w innych szpitalach. Był także kolejno Holme Professor of Clinical Medicine i profesor zasad i praktyki medycyny w University College London.

Został wybrany na prezydenta Towarzystwa Epidemiologicznego w 1866-1868, Towarzystwa Patologicznego w 1873-1875 i Towarzystwa Klinicznego w 1875 roku. Był prezydentem Royal College of Physicians od 1881 do 1888, gdzie wygłosił Goulstonian Lectures w 1853 roku. W 1864 roku został wybrany Fellow of the Royal Society (F.R.S.) i otrzymał tytuły honorowe od University of Oxford, University of Cambridge i University of Edinburgh. W 1861 r. został mianowany Physician Extraordinary (Q.H.P.), a w 1862 r. Physician in Ordinary przy królowej Wiktorii, a w 1863 r. Physician in Ordinary przy księciu Walii; towarzyszył zarówno księciu konsorcjum, jak i księciu Walii podczas ich ataków tyfusu plamistego. W 1868 roku został mianowany baronetem.

Jako konsultant, Sir William Jenner miał wielką reputację i pozostawił duży majątek, kiedy zmarł, w Bishops Waltham, Hants, 11 grudnia 1898 roku, po czym wycofał się z praktyki na osiem lat z powodu słabnącego zdrowia. Ożenił się w 1858 r. z Adelą Lucy Leman, córką Stephena Adey’a, z którą miał pięciu synów i jedną córkę. Jego najmłodszy syn, Leopold, był odznaczonym oficerem armii z I wojny światowej.

.