Najobficiej występującymi lipidami błonowymi są fosfolipidy . Mają one polarną grupę główną i dwa hydrofobowe ogony węglowodorowe. Ogony są zazwyczaj kwasy tłuszczowe i mogą różnić się długością.

Hydrofilowe cząsteczki łatwo rozpuszczają się w wodzie, ponieważ zawierają naładowane grupy lub nienaładowane grupy polarne, które mogą tworzyć albo korzystne oddziaływania elektrostatyczne lub wiązania wodorowe z cząsteczkami wody
Hydrofobowe cząsteczki są nierozpuszczalne w wodzie, ponieważ wszystkie lub większość ich atomy są nienaładowane i nie polarne. Nie mogą one tworzyć energetycznie korzystne interakcje z water molecules.
Jeśli rozproszone w wodzie , zmuszają sąsiednie cząsteczki wody do reorganizacji w lodzie jak klatki, które otaczają hydrophobic molecules.

Z powyższego powodu, cząsteczki lipidów spontanicznie agregacji pochować ich hydrofobowe ogony w środku i wystawiać ich hydrofobowe głowy do water.

Being cylindryczne cząsteczki fosfolipidów spontanicznie tworzą bilayer w środowisku wodnym. W tym energetycznie najkorzystniejszym układzie, hydrofilowe głowy , zwrócone do wody na każdej powierzchni dwuwarstwy i hydrofobowe ogony są osłonięte od wody we wnętrzu.

.