Articles

Co to jest WPRE?

Posttranskrypcyjny element regulatorowy (WPRE) wirusa Woodchuck Hepatitis Virus (WHP) jest sekwencją DNA, która po transkrypcji tworzy strukturę trzeciorzędową zwiększającą ekspresję. Powszechnie stosowana w biologii molekularnej do zwiększania ekspresji genów dostarczanych przez wektory wirusowe. WPRE jest trójdzielnym elementem regulatorowym z komponentami gamma, alfa i beta. Komponent alfa ma długość 80bp:

GCCACGGCGGAACTCATCGCCGCCTGCCTTGCCCGCTGCTGGACAGGGCTCGCTGTGTTGGCACTGACAATTCCGTGTGT

Kiedy jest używany samodzielnie bez komponentów gamma i beta WPRE, komponent alfa jest tylko w 9% tak aktywny jak pełny trójdzielny WPRE. Sekwencja dla pełnego trójdzielnego WPRE jest jak następuje.
TCGACAATCAACCTCTGGATTACAAAATTTGTGAAAGATTGACTGGTATTCTTAACTATGTTGCTCCTTTTACGCTATGTGGATACGCTGCTTTAATGCCTTTGTA
TCATGCTATTGCTTCCCGTATGGCTTTCATTTTCTCCTCCTTGTATAAATCCTGGTTGCTGTCTCTTTATGAGGAGTTGTGGCCCGTTGTCAGGCAACGTGGCGTG
GTGTGCACTGTGTTTGCTGACGCAACCCCCACTGGTTGGGGCATTGCCACCACCTGTCAGCTCCTTTCCGGGACTTTCGCTTTCCCCCTCCCTATTGCCACGGCGG
AACTCATCGCCGCCTGCCTTGCCCGCTGCTGGACAGGGGCTCGGCTGTTGGGCACTGACAATTCCGTGGTGTTGTCGGGGAAGCTGACGTCCTTTCCATGGCTGCT
CGCCTGTGTTGCCACCTGGATTCTGCGCGGGACGTCCTTCTGCTACGTCCCTTCGGCCCTCAATCCAGCGGACCTTCCTTCCCGCGGCCTGCTGCCGGCTCTGCGG
CCTCTTCCGCGTCTTCGCCTTCGCCCTCAGACGAGTCGGATCTCCCTTTGGGCCGCCTCCCCGCCTG

Sekwencja ta ma 100% homologii z parami zasad 1093 do 1684 genomu wirusa zapalenia wątroby typu B (WHV8) u kaczora leśnego. Gdy jest stosowana w 3′ UTR kasety ekspresyjnej ssaków, może znacznie zwiększyć stabilność mRNA i wydajność białka.

.