Articles

Xiphophorus Genetic Stock Center

Dr Manfred Schartl

Co-PI för XGSC

Mitt huvudsakliga forskningsintresse är de molekylära processerna i organismisk utveckling och deras felfunktion i cancerogenes. Ett viktigt ämne är signaltransduktion och genreglering i melanom. Jag använder Xiphophorus-modellsystemet och transgena medaka som utvecklar olika typer av pigmentcellstumörer. Förutom klassiska verktyg för biokemisk karakterisering av signaltransduktion och transkriptionsreglering använder jag genomsekvensering och RNA-Seq transkriptomik i en komparativ ansats av fiskmodeller med data från människor för att identifiera nya melanomgener och små icke-kodande RNA:er som är involverade i övergången från en godartad pigmentförändring till malignt melanom. För funktionella studier har vi satt upp olika cellodlingssystem från fisk, mus och humant melanom för att mäta avläsningar av enskilda maligna omvandlingsparametrar. Detta kompletteras av studier med transgena och CRISPR/Cas9 knockout-fiskar. Mitt team har varit pionjär när det gäller användningen av små akvariefiskmodeller för cancerforskning. Efter att ha isolerat den första melanomonkogenen från en modellorganism har vår forskning avslöjat betydelsen av Ras/Raf/MAPK-signalering för melanombildning, som i dag erkänns vara ansvarig för mer än 60 % av de mänskliga melanomen. Även om min forskning har sina rötter i den grundläggande vetenskapen för att förstå den genetiska, molekylära och cellulära grunden för cancerbildning har jag alltid lagt stor vikt vid den translationella aspekten av mina resultat. Jag har inrättat grupper av assisterande och biträdande professorer vid min professur som arbetar med musmodeller och mänskliga cancercellinjer och har ofta samarbetat med kliniska forskare. Jämförande studier har resulterat i karakterisering av molekyler och cellulära processer som först upptäcktes i fiskmodeller och som visar relevans för diagnostik och terapi av den mänskliga sjukdomen. Vid medicinska fakulteten vid mitt universitet har jag tagit initiativ till användningen av nästa generations sekvensering vid diagnostisering av cancerpatienter. Jag har tillsammans med mina kollegor från dermatologin utvecklat en riktad genetisk diagnos med sekvensering för melanompatienter, som nu har anpassats till den nya tekniska utvecklingen. Detta program var så framgångsrikt att andra kliniska enheter vid Comprehensive Cancer Center snabbt också har antagit denna metodik för sina patienter. I vårt NIH-finansierade projekt tillsammans med mina kollegor vid Texas State University har jag utvecklat ett nytt screeningssystem baserat på transkriptomförändringar i melanom som utvecklar fisk för upptäckt av läkemedel mot cancer från testning av kemiska bibliotek med hög genomströmning.

Google Scholar

.