Willi Hennig, (född 20 april 1913 i Dürrhennersdorf, Sachsen, Tyskland – död 5 november 1976 i Ludwigsburg, Västtyskland), tysk zoolog, erkänd som den ledande förespråkaren för den kladistiska skolan inom fylogenetisk systematik.

Enligt denna tankesätt bör taxonomiska klassificeringar uteslutande återspegla genealogiska relationer. I praktiken skulle organismerna grupperas strikt på grundval av de historiska sekvenser genom vilka de härstammar från en gemensam förfader. Detta skiljer sig avsevärt från den evolutionära systematiken, den traditionella skolan som anser att taxonomiska klassificeringar bör baseras på genetiska och genealogiska släktskap. Hennig definierade grunderna för det nya tillvägagångssättet i sin Grundzüge einer Theorie der phylogenetischen Systematik (1950; Phylogenetic Systematics, 1979) och försökte visa att det integrerade biologins metoder och mål med metoder och mål från sådana discipliner som paleontologi, geologi och biogeografi (dvs,

Hennig disputerade i zoologi vid universitetet i Leipzig 1947 och utförde sedan omfattande forskning om larver av Diptera (den insektsordning som omfattar flugor, myggor och gnagare) vid det tyska entomologiska institutet i Östberlin. Han publicerade resultaten av sitt arbete i monografin Larvenformen der Dipteren (1952; ”Dipterous Larvae”), som blev standardverket i ämnet. Han utvidgade senare sina studier om dipteraner till att omfatta de arter av ordningen som finns på Nya Zeeland, vilket gav honom möjlighet att tillämpa principerna för kladistisk klassificering på biogeografiska rön. År 1961 avgick Hennig från institutet, där han hade varit chef för avdelningen för systematisk entomologi sedan 1949, i protest mot Östtysklands uppförande av Berlinmuren. Två år senare, efter att ha flyttat till Västtyskland, utnämndes han till chef för fylogenetisk forskning vid det statliga naturhistoriska museet i Stuttgart.