Articles

Vad är WPRE?

Woodchuck Hepatitis Virus (WHP) Posttranscriptional Regulatory Element (WPRE) är en DNA-sekvens som när den transkriberas skapar en tertiär struktur som ökar uttrycket. Används ofta inom molekylärbiologin för att öka uttrycket av gener som levereras av virala vektorer. WPRE är ett tredelat reglerande element med gamma-, alfa- och betakomponenter. Alfakomponenten är 80 bp lång:

GCCACGGCGGAACTCATCGCCGCCGCCTGCCTTGCCCCCTGCTGCTGCTGGACACAGGGGCTCGGCTGCTGTTGGGGGCACTGACAATTCCGTGGT

Om den används ensam, utan gamma- och beta-WPRE-komponenterna, är alfakomponenten endast 9 % så aktiv som den fullständiga tredelade WPRE. Sekvensen för fullständig tredelad WPRE är följande.
TCGACAATCAACCTCTGGATTACAAAATTTGTGAAAGATTGACTGGTATTCTTAACTATGTTGCTCCTTTTACGCTATGTGGATACGCTGCTTTAATGCCTTTGTA
TCATGCTATTGCTTCCCGTATGGCTTTCATTTTCTCCTCCTTGTATAAATCCTGGTTGCTGTCTCTTTATGAGGAGTTGTGGCCCGTTGTCAGGCAACGTGGCGTG
GTGTGCACTGTGTTTGCTGACGCAACCCCCACTGGTTGGGGCATTGCCACCACCTGTCAGCTCCTTTCCGGGACTTTCGCTTTCCCCCTCCCTATTGCCACGGCGG
AACTCATCGCCGCCTGCCTTGCCCGCTGCTGGACAGGGGCTCGGCTGTTGGGCACTGACAATTCCGTGGTGTTGTCGGGGAAGCTGACGTCCTTTCCATGGCTGCT
CGCCTGTGTTGCCACCTGGATTCTGCGCGGGACGTCCTTCTGCTACGTCCCTTCGGCCCTCAATCCAGCGGACCTTCCTTCCCGCGGCCTGCTGCCGGCTCTGCGG
CCTCTTCCGCGTCTTCGCCTTCGCCCTCAGACGAGTCGGATCTCCCTTTGGGCCGCCTCCCCGCCTG

Denna sekvens har 100 % homologi med basparen 1093-1684 i Woodchuck hepatit B-virusets (WHV8) genom. När den används i 3′ UTR i en uttryckskassett för däggdjur kan den avsevärt öka mRNA-stabiliteten och proteinutbytet.