Subansamblele de conținut WoRMS sunt puse la dispoziție, și pot avea o etichetă separată și propriile pagini de pornire, ca „subregistre”, cum ar fi World List of Marine Acanthocephala, World List of Actiniaria, World Amphipoda Database, World Porifera Database și așa mai departe. În decembrie 2018, existau 60 de astfel de subregistre taxonomice, inclusiv un număr aflat în prezent în construcție. O a doua categorie de subregistre cuprinde baze de date regionale privind speciile, cum ar fi Registrul african al speciilor marine, Registrul belgian al speciilor marine etc., în timp ce o a treia categorie cuprinde subseturi tematice, cum ar fi Registrul mondial al speciilor de mare adâncime (WoRDSS), Registrul mondial al speciilor marine introduse (WRiMS) etc. În toate aceste cazuri, datele de bază sunt introduse și păstrate o singură dată ca parte a sistemului de date WoRMS, pentru a facilita întreținerea și coerența datelor, și sunt rediscutate în funcție de necesități în contextul subregistrului sau al subregistrelor relevante din care pot face parte și ele.

Cerase subregistre extind conținutul dincolo de conceptul inițial „marin” al WoRMS prin includerea taxonilor de apă dulce sau terestre pentru completitudine în zona lor de interes desemnată; aceste înregistrări pot fi excluse dintr-o căutare standard în WoRMS prin selectarea opțiunilor corespunzătoare în interfața de căutare online.

.