Detta kapitel beskriver aminoacyl-tRNA-syntetasers erkännande av tRNAs. Det mycket specifika urvalet av tRNA-substrat av aminoacyl-tRNA-syntetaser är ett spännande problem inom RNA-proteinigenkänning. Syntetaser som är specifika för var och en av de 20 aminosyrorna möter en pool av tRNAs i cellen som har liknande övergripande strukturer. Valet av lämpliga tRNA för bindning av varje aminosyra sker genom att det bildas RNA-proteinkontakter som är unika för varje tRNA-syntetaspar. De platser i tRNA som styr dessa interaktioner har undersökts med hjälp av en rad olika tekniker som diskuteras i kapitlet, t.ex. tester av tRNA:s aminosyraacceptorspecificitet. Anticodons roll i erkännandet, acceptanstammarnas och diskriminatorbasernas roll samt modifierade basers roll diskuteras i kapitlet. Anticodonet krävs inte för igenkänning av tRNAAIa, och möjligen tRNASer; dessa och alla andra E. coli tRNAs innehåller troligen identitetselement i anticodonet som är avgörande för syntetasernas särskiljning av kognitiva och icke-kognitiva tRNAs in vivo. Dessutom innehåller ett antal E. coli tRNAs viktiga igenkänningselement för deras kognata syntetaser i acceptanstammen och/eller på diskriminatorplatsen.