Subsets of WoRMS content are made available, and can have separate badging and their own home/launch pages, as “subregisters”, such as the World List of Marine Acanthocephala, World List of Actiniaria, World Amphipoda Database, World Porifera Database, e assim por diante. Em Dezembro de 2018 existiam 60 sub-registros taxonómicos deste tipo, incluindo um número actualmente em construção. Uma segunda categoria de subregistros inclui bases de dados regionais de espécies como o Registo Africano de Espécies Marinhas, Registo Belga de Espécies Marinhas, etc., enquanto uma terceira categoria inclui subconjuntos temáticos como o Registo Mundial de Espécies de Águas Profundas (WoRDSS), Registo Mundial de Espécies Marinhas Introduzidas (WRiMS), etc. Em todos estes casos, os dados de base são introduzidos e mantidos apenas uma vez como parte do sistema de dados WoRMS para facilidade de manutenção e consistência de dados, e são reexibidos conforme necessário no contexto do subregisto ou subregistros relevantes aos quais eles também podem pertencer.

Determinados subregistros expandem o conteúdo além do conceito original “marinho” do WoRMS, incluindo taxas de água doce ou terrestre para a integridade em sua área de interesse designada; tais registros podem ser excluídos de uma pesquisa padrão do WoRMS selecionando as opções apropriadas na interface de pesquisa on-line.