ウィンチェスター症候群は、MMP14遺伝子（MT1-MMPとしても知られている）の変異によって引き起こされる。 この遺伝子は、細胞表面に存在するマトリックスメタロペプチダーゼ14と呼ばれるタンパク質を作るための命令を提供します。 マトリックスメタロペプチダーゼ14は通常、細胞外マトリックスの様々な構成要素を修飾し、分解するのに役立つ。マトリックスマトリックスは、タンパク質と他の分子が複雑に絡み合った格子状で、細胞と細胞の間に形成されている。 これらの変化は、細胞増殖の促進や細胞移動の促進など、多くの細胞活動や機能に影響を与える。 マトリックスメタロペプチダーゼ14は、マトリックスメタロペプチダーゼ2と呼ばれるタンパク質もオンにする（活性化する）。 MMP14遺伝子の変異は、マトリックスメタロペプチダーゼ14を変化させ、細胞表面に到達できる酵素の量を減少させます。 その結果、細胞外マトリックスの成分を分解し、マトリックス・メタロペプチダーゼ2を活性化するのに十分な酵素が得られない。 この酵素の不足が、どのようにしてウィンチェスター症候群の症状や徴候につながるのかは不明である。 マトリックス・メタロペプチダーゼ2の活性化が失われると、骨のリモデリングの際に新しい骨の生成と既存の骨の破壊のバランスが何らかの形で崩れ、骨組織が徐々に失われていく可能性がある。 マトリックスメタロペプチダーゼ14の減少が、どのようにしてウィンチェスター症候群の他の特徴につながるかは不明である

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