A Woods Hole Kutatóközpontot 1985-ben George Woodwell alapította a massachusettsi Woods Hole-ban. A WHRC volt az egyik első olyan szervezet, amely a globális éghajlatváltozás elleni küzdelemmel foglalkozott. 1986-ban Woodwell tanúvallomást tett a Kongresszus előtt a tengerszint emelkedésének és a globális felmelegedés veszélyeiről.

A Woods Hole Kutatóközpontban az 1980-as évek végén Woodwell és Kilaparti Ramakrishna dolgozta ki az ENSZ Éghajlatváltozási Keretegyezményének kidolgozására vonatkozó tervet. 2005-ben Dr. John P. Holdren lett az igazgató, aki egészen addig vezette a szervezetet, amíg 2009-ben Obama elnök tudományos tanácsadójává nem nevezték ki. Holdren 2017-ben, Obama elnök hivatalából való távozása után vezető tanácsadóként tért vissza a WHRC-hez.

2020-ban a Központot átkeresztelték Woodwell Klímakutató Központra, hogy hangsúlyozzák az éghajlatváltozással kapcsolatos tudományos fókuszt és tisztelegjenek az alapító, George Woodwell előtt.

A szervezet jelenlegi elnöke Dr. Philip Duffy fizikus, aki korábban a Fehér Ház Nemzeti Tudományos és Technológiai Tanácsának vezető tanácsadója volt az amerikai globális változáskutatási programban. A Woodwell Climate mintegy 80 munkatársat foglalkoztat.

A központ Gilman Ordway Campusát, amely Cape Codon, Falmouth városában található, 2004-ben fejezték be. A 19 300 négyzetméteres (1790 m2) épület egy felújított nyári birtokból (kb. 1874) és egy új szárnyból áll. A campus energiasemleges, a megújuló energiát egy 100 kW-os szélturbina, valamint a tetőkön elhelyezett fotovoltaikus energiarendszerek termelik.