TY – JOUR

T1 – Structural basis of substrate binding in WsaF, a rhamnosyltransferase from Geobacillus stearothermophilus

AU – Steiner, Kerstin

AU – Hageluken, Gregor

AU – Messner, Paul

AU – Schaeffer, Christina

AU – Naismith, James Henderson

PY – 2010/3/26

Y1 – 2010/3/26

N2 – A szénhidrát polimerek orvosi és ipari jelentőségűek. Számos Gram-pozitív organizmus S-rétege fehérje- és szénhidrátpolimerekből áll, és szinte parakristályos elrendeződést alkot a sejtfelszínen. Ez a tömb nemcsak a baktériumok számára fontos, hanem potenciálisan alkalmazható a kereskedelmi szempontból fontos poliszacharidok és glikokonjugátok előállításában is. A Geobacillus stearothermophilus NRS 2004/3a S-rétegű glikoprotein glikánja főként három, alfa-1,3-, alfa-1,2- és béta-1,2-kötésekkel összekapcsolt ramnózcukor ismétlődő egységeiből áll. A béta-1,2-kötés kialakulását a WsaF enzim katalizálja. E rendszer ésszerű felhasználását nehezíti az a tény, hogy a WsaF és az útvonal más enzimei nagyon kevés homológiát mutatnak más enzimekkel. Beszámolunk a WsaF, az első ilyen ramnozil-transzferáz szerkezeti és biokémiai jellemzéséről. A szerkezeti munkát a felületi entrópia redukciós módszerrel segítettük. Az enzimnek két doménje van, az N-terminális domén, amely az akceptort (a növekvő ramnózláncot) köti, és a C-terminális domén, amely a szubsztrátot (dTDP-béta-L-ramnóz) köti. A dTDP-hez és dTDP-béta-L-ramnózhoz kötött WsaF szerkezete biokémiai elemzéssel összekapcsolva azonosítja a katalízis és a szubsztrátfelismerés alapjául szolgáló maradékokat. Hely-irányított mutagenezissel felépítettünk és teszteltünk egy modellt az akceptorfelismerésre. (C) 2010 Elsevier Ltd. Minden jog fenntartva.

AB – A szénhidrát polimerek orvosi és ipari szempontból egyaránt fontosak. Számos Gram-pozitív organizmus S-rétege fehérje- és szénhidrátpolimerekből áll, és szinte parakristályos elrendeződést alkot a sejtfelszínen. Ez a tömb nemcsak a baktériumok számára fontos, hanem potenciálisan alkalmazható a kereskedelmi szempontból fontos poliszacharidok és glikokonjugátok előállításában is. A Geobacillus stearothermophilus NRS 2004/3a S-rétegű glikoprotein glikánja főként három, alfa-1,3-, alfa-1,2- és béta-1,2-kötésekkel összekapcsolt ramnózcukor ismétlődő egységeiből áll. A béta-1,2-kötés kialakulását a WsaF enzim katalizálja. E rendszer ésszerű felhasználását nehezíti az a tény, hogy a WsaF és az útvonal más enzimei nagyon kevés homológiát mutatnak más enzimekkel. Beszámolunk a WsaF, az első ilyen ramnozil-transzferáz szerkezeti és biokémiai jellemzéséről. A szerkezeti munkát a felületi entrópia redukciós módszerrel segítettük. Az enzimnek két doménje van, az N-terminális domén, amely az akceptort (a növekvő ramnózláncot) köti, és a C-terminális domén, amely a szubsztrátot (dTDP-béta-L-ramnóz) köti. A dTDP-hez és dTDP-béta-L-ramnózhoz kötött WsaF szerkezete biokémiai elemzéssel összekapcsolva azonosítja a katalízis és a szubsztrátfelismerés alapjául szolgáló maradékokat. Hely-irányított mutagenezissel felépítettünk és teszteltünk egy modellt az akceptorfelismerésre. (C) 2010 Elsevier Ltd. All rights reserved.

KW – Kristályszerkezet

KW – Geobacillus stearothermophilus

KW – Ramnozil-transzferáz

KW – S-rétegű fehérjék glikozilációja

KW – Glikoprotein glikán bioszintézis

KW – Glikoprotein glikánok bioszintézise

KW – Glikoprotein glikánok bioszintézise

KW Mannosziltreansferáz pima

KW – Glikogén-szintáz

KW – Diffrakciós adatok

KW – Gén-klaszter

KW – Gén-klaszter

KW – GT4 család

KW – Glikoziltranszferázok

KW – Katalízis

KW – Szekvencia

UR – http://www.scopus.com/inward/record.url?scp=77349090654&partnerID=8YFLogxK

.