Két felmérési szakaszban (2003 és 2008) organikus, tápanyag- és sószennyezési paramétereket vizsgáltak a Werra alsó szakaszán annak érdekében, hogy megbecsüljék e különböző szennyezések jelentőségét a makrogerinctelenek minőségi összetevőjére nézve az európai vízügyi keretirányelvnek megfelelően. A kémiai és biológiai vizsgálatokat egy sószennyezés nélküli “referencia” szakasz és a Werra torkolatához közeli Vacha és Hannoversch Münden közötti, a kálisó bányászat miatt sószennyezett szakasz összehasonlításával végezték. Az eredmények azt mutatják, hogy a Werra makrogerinctelen állományai közötti drasztikus különbségeket a sóval szennyezett szakaszok fel- és lefolyása között egyértelműen a sóterhelés okozza. Az egyéb kémiai hatások nem felelősek a fenékgerinctelenek összetételében megfigyelt alapvető változásért. A patak morfológiájának makrogerinctelenek által jelzett általános romlása jó ökológiai állapotot mutat a folyó sóval nem szennyezett szakaszán és rossz állapotot a Werra alsó szakaszának sóval szennyezett részein.