Mi a WPRE?
A Woodchuck Hepatitis Virus (WHP) poszttranszkripciós szabályozó eleme (WPRE) egy olyan DNS-szekvencia, amely átíráskor egy tercier szerkezetet hoz létre, amely fokozza az expressziót. Gyakran használják a molekuláris biológiában a vírusvektorok által szállított gének expressziójának fokozására. A WPRE egy gamma, alfa és béta komponensekkel rendelkező hármas szabályozó elem. Az alfa komponens 80bp hosszú:
GCCACGGCGGAACTCATCGCCGCCTGCCTTGCCCGCTGCTGGGACAGGGGCTCGGCTGTTGTTGGGCACTGACAATTCCGTGGT
A gamma és béta WPRE komponensek nélkül önmagában használva az alfa komponens csak 9%-ban olyan aktív, mint a teljes hármas WPRE. A teljes tripartit WPRE szekvenciája a következő.
TCGACAATCAACCTCTGGATTACAAAATTTGTGAAAGATTGACTGGTATTCTTAACTATGTTGCTCCTTTTACGCTATGTGGATACGCTGCTTTAATGCCTTTGTA
TCATGCTATTGCTTCCCGTATGGCTTTCATTTTCTCCTCCTTGTATAAATCCTGGTTGCTGTCTCTTTATGAGGAGTTGTGGCCCGTTGTCAGGCAACGTGGCGTG
GTGTGCACTGTGTTTGCTGACGCAACCCCCACTGGTTGGGGCATTGCCACCACCTGTCAGCTCCTTTCCGGGACTTTCGCTTTCCCCCTCCCTATTGCCACGGCGG
AACTCATCGCCGCCTGCCTTGCCCGCTGCTGGACAGGGGCTCGGCTGTTGGGCACTGACAATTCCGTGGTGTTGTCGGGGAAGCTGACGTCCTTTCCATGGCTGCT
CGCCTGTGTTGCCACCTGGATTCTGCGCGGGACGTCCTTCTGCTACGTCCCTTCGGCCCTCAATCCAGCGGACCTTCCTTCCCGCGGCCTGCTGCCGGCTCTGCGG
CCTCTTCCGCGTCTTCGCCTTCGCCCTCAGACGAGTCGGATCTCCCTTTGGGCCGCCTCCCCGCCTG
Ez a szekvencia 100%-os homológiát mutat a Woodchuck hepatitis B vírus (WHV8) genomjának 1093-1684 bázispárjával. Emlős expressziós kazetta 3′ UTR-ében használva jelentősen növelheti az mRNS stabilitását és a fehérje hozamát.