Ez a fejezet a tRNS-ek felismerését írja le az aminoacil-tRNS-szintetázok által. A tRNS-szubsztrátoknak az aminoacil-tRNS-szintetázok általi rendkívül specifikus kiválasztása az RNS-fehérje felismerés egyik érdekes problémája. A 20 aminosav mindegyikére specifikus szintetázok a sejtben hasonló általános szerkezetű tRNS-ek csoportjával találkoznak. Az egyes aminosavak rögzítéséhez megfelelő tRNS-ek kiválasztása az egyes kognitív tRNS-szintetáz párokra jellemző RNS-fehérje kapcsolatok kialakításával történik. A tRNS-ek e kölcsönhatásokat szabályozó helyeit a fejezetben tárgyalt különböző technikákkal vizsgálták, például a tRNS-ek aminosav-akceptor-specifikusságának vizsgálatával. A fejezetben tárgyaljuk az antikodon szerepét a felismerésben, az akceptor Stem és a diszkriminátor bázis szerepét, valamint a módosított bázisok szerepét. Az antikodon nem szükséges a tRNAAIa és valószínűleg a tRNASer felismeréséhez; ezek és az összes többi E. coli tRNS valószínűleg tartalmaznak az antikodonban olyan azonossági elemeket, amelyek döntő fontosságúak a kognitív és nem kognitív tRNS-ek szintetázok általi megkülönböztetésében in vivo. Ezenkívül számos E. coli tRNS tartalmaz fontos felismerő elemeket a kognitív szintetázok számára az akceptor szárban és/vagy a diszkriminátorhelyen.