Méthodes

Modèle d’étude et zone d’étude

Il s’agissait d’une étude transversale menée de juin à septembre 2018 dans les hôpitaux régionaux de référence d’Amana, Temeke et Kinondoni à Dar es salaam, en Tanzanie. Nous avons inscrit consécutivement 158 patients avec des demandes de test Widal de la part des médecins après avoir obtenu un consentement éclairé verbal et écrit.

Population étudiée

Patients âgés de 5 à 82 ans fréquentant la clinique de l’hôpital de référence de Dar es Salaam soupçonnés d’avoir une fièvre typhoïde par leurs cliniciens traitants.

Prélèvement et traitement des échantillons

Un technologue bien formé a prélevé 5-10 mls d’échantillons de sang veineux de manière aseptique selon l’âge du participant. 3-8 ml selon l’âge ont été inoculés directement dans le bouillon et 2-3 ml ont été recueillis dans des tubes vacutainer ordinaires pour le widal.

Une cuillère d’échantillon de selles a été recueillie dans des récipients propres.

Tests de laboratoire typhoïde

Test de Widal

Nous avons utilisé du sérum pour détecter les antigènes O et H spécifiques. Une goutte d’antigènes O et d’antigènes H a été ajoutée dans les tubes à essai, en quantité égale dans tous. Sur la base du manuel du fabricant, un titre d’anticorps de 1:80 et plus pour les anticorps anti TO et de 1:160 et plus pour les anticorps anti TH a été pris comme valeur seuil pour indiquer une infection récente de fièvre typhoïde.

Culture en laboratoire

Nous avons inoculé sur des plaques de gélose MacConkey et xylose, lysine désoxycholate et incubé à 37 °C pendant 48 h. Nous avons soumis à la coloration de Gram les colonies suspectes de Salmonella et identifié de manière présomptive en utilisant la gélose au fer de Kligler (Difco™), le test à l’uréase (Himedia ltd. Inde), l’indole, l’oxydase citrate, la motilité.

Cultures de sang

Le bouillon a été préparé à partir de 10% de gélose ox-gall/Columbia dans de l’eau distillée. (Ajouter 5 ml de sang entier à 50 ml de milieu ox-bile stérile. Après l’incubation d’une nuit, la sous-culture et l’identification biochimique ont été effectuées à partir de la gélose ox-gall/Columbia à 10% sur de la gélose XLD (OXOID, Angleterre).

Dans la gélose XLD : les salmonelles productrices de H2S ont formé des colonies rouge rosé de 3 à 5 mm de diamètre avec des centres noirs.

Dans la gélose MacConkey : les salmonelles ont produit des colonies de couleur pâle ne fermentant pas le lactose. Tous ces milieux et bouillons utilisés seront préparés selon les instructions du fabricant.

Identification biochimique

Les salmonelles ont été identifiées de manière présomptive en utilisant la gélose au fer de Kligler, (Difco™), le test à l’uréase (Himedia ltd. India), l’indole, l’oxydase citrate, la motilité.

Contrôle de qualité

Les procédures opérationnelles standard ont été suivies pendant le traitement de chaque échantillon. Tous les instruments utilisés pour le traitement des échantillons ont été vérifiés chaque matin pour leur bon fonctionnement.

E. coli ATCC 25922 a été utilisé comme souche de référence.

Analyse et gestion des données

Nous avons recoupé et codé les données sur les résultats du laboratoire avant de les saisir dans le logiciel informatique. Les données ont été nettoyées et analysées à l’aide du progiciel statistique pour les sciences sociales (SPSS) version 23.0 (logiciel SPSS Chicago Inc., USA). La synthèse des données a été effectuée à l’aide de la distribution de fréquences et de tableaux à double sens ; l’association entre les autres variables indépendantes et dépendantes a été déterminée à l’aide du test du chi-deux ou du kappa. La valeur de kappa, < 0,09 ; 0,1-0,19 ; 0,2-0,49 ; et > 0,5 ont été considérés comme un accord faible, modéré, fort et presque parfait respectivement. La valeur p de < 0,05 a été considérée comme statistiquement significative.

Résultats

Caractéristiques des participants

Nous avons recruté 158 patients. L’âge médian était de 34 ans, la moyenne de 31 ans et les femmes 62%. Les participants avaient soit un niveau d’éducation secondaire 43,8% ou un niveau d’éducation inférieur 41,2%. La majorité des participants étaient soit mariés 62 (40%) ou divorcés 42 (27,1%). Les réponses des patients sur la non-utilisation d’antibiotiques dans les 2 semaines, 1 semaine et 3 jours respectivement, 93 (58,5%), 47 (28,9%) et 13 (8,2%). Sur le timing de 2 semaines, 1 semaine et 3 jours respectivement la réponse de la maladie était de 74 (46,4%), 47 (29,6%) et 7 (4,4%) (tableau 1).

8 des 93 non utilisateurs d’antibiotiques 2 semaines avant la visite à l’hôpital, 8 étaient positifs à l’hémoculture. 1 des 13 utilisateurs d’antibiotiques 1 semaine avant de venir à l’hôpital était positif aux hémocultures et 2 des 46 qui ont utilisé des antibiotiques dans les 2 semaines avant de venir à l’hôpital étaient positifs aux hémocultures.

La durée moyenne (écart-type) de la maladie était de 6 (4). Parmi les 74 patients qui sont tombés malades en une semaine, seuls huit étaient positifs à l’hémoculture, 47 en 2 semaines, seuls six étaient positifs et parmi les 25 qui ont commencé à se sentir malades en 3 semaines, seuls 3 étaient positifs à l’hémoculture.

Sensibilité, spécificité et valeurs prédictives de l’hémoculture et de la coproculture dans le diagnostic de la fièvre typhoïde en utilisant l’hémoculture comme méthode standard

Sur les 158 échantillons de sang mis en culture, 16 (10,1%) étaient positifs pour S. typhi. Ainsi, la prévalence globale de la fièvre typhoïde dans la population étudiée était de 10,1%. La prévalence selon Widal était de 80,5% tandis que la prévalence selon la culture des selles était de 11% où les isolats dans les selles n’étaient pas sérotypés (tableau 2).

Par rapport à l’hémoculture, la coproculture avait une sensibilité, une spécificité, une valeur prédictive positive (VPP) et une valeur prédictive négative (VPN) de 31.25%, 91, 5%, 29,4% et 92,2%, respectivement, tandis que le test de Widal avait une sensibilité, une spécificité, une VPP et une VPN de 81,5%, 18,3%, 10,1% et 89,6%, respectivement (tableau 2).

Discussion

Alors que le monde continue à lutter contre la résistance aux antimicrobiens, un diagnostic correct, rapide et précis est nécessaire vers l’archivage de l’objectif. En Tanzanie, les maladies fébriles telles que la fièvre typhoïde sont parmi les maladies qui sont couramment diagnostiquées. Par conséquent, une expérience a été faite pour évaluer la précision diagnostique du test de Widal et de la culture des selles couramment réalisés tout en gardant l’hémoculture comme norme d’or.

La prévalence réelle de la fièvre typhoïde a été trouvée à 10,1%, ce qui signifie que pour 10 patients qui sont testés positifs, et seulement un était vraiment souffrant de la typhoïde. La prévalence rapportée dans cette étude a également été rapportée dans d’autres études menées au Cameroun .

Les conséquences des résultats faussement positifs comprennent une mauvaise utilisation des antibiotiques, le danger probable d’augmenter la résistance aux antibiotiques, l’augmentation du coût du traitement en raison de l’augmentation du séjour à l’hôpital pour les patients hospitalisés et l’absence de maladie mortelle des maladies fébriles.

La sensibilité, la spécificité, la VPP et la VPN du titrage de Widal dans cette étude étaient respectivement de 81,2% 18,3%, 10,1 et 89,7. Le test Widal avait une sensibilité et une valeur prédictive négative correctes ; il avait également une spécificité et une valeur prédictive positive très faibles. Cela pourrait être dû à des anticorps à réaction croisée provenant d’autres entérobactéries. Une faible spécificité signifie que les patients pourraient souffrir d’autres causes de maladies et une faible valeur VPP signifie que la majorité de ceux qui ont été testés pour avoir une maladie ne sont pas vraiment malades par la cause suspectée.

Une revue systématique a trouvé la sensibilité moyenne, la spécificité, la VPP et la VPN de 73,5 avec SD 12,6 minimum de 45,2 et maximum de 98, 75,7 avec SD de 20,2, minimum 13,8 et maximum de 98, 75,2 avec SD 24,8 minimum de 31 maximum de 100 et 60 avec SD de 29 minimum de 5,7 et maximum de 91 respectivement. Les résultats de cette étude sont dans la gamme de la revue systématique.

Etudes en Tanzanie, Mtove dans l’hôpital Teule Muheza trouvé, la sensibilité, la spécificité, NPV et PPV 75%, 98%, 100%, et 26% respectivement. Toutes ces études concordent avec les résultats de l’examen. L’étude a trouvé que la culture des selles avait une sensibilité, une spécificité, une VPP et une VPN de 31,3, 91,5, 29 et 92,2 respectivement. La faible sensibilité peut être associée au temps de collecte des échantillons. Les selles ne sont pas sensibles dans les infections précoces. La sensibilité peut être augmentée lorsque l’échantillon est prélevé au cours de la troisième semaine. Dans la culture des selles, la croissance de Salmonella n’est pas synonyme d’infection, car cette méthode peut être utilisée pour identifier les porteurs. Elle est positive dans 35% des cas dans les infections précoces.

Systematic review , la culture des selles avait une sensibilité, une spécificité, une VPP et une VPN de 71,4%, 66,7, 83 et 50 respectivement. Ces résultats sont en corrélation avec les résultats de l’étude actuelle. Cela est dû au fait d’être enclin à la contamination qui peut entraîner un mauvais diagnostic.

Comparant les tests, les selles ont mieux performé en termes de spécificité et de valeur prédictive négative. La culture des selles avait une bonne VPN de 92,2 et une spécificité de 91,5% tandis que le test de Widal avait une spécificité de 18,3 et une VPN de 89,7%. D’autre part, le test de Widal a donné de meilleurs résultats en termes de sensibilité que la coproculture. Le test Widal avait une sensibilité de 81,2 et la culture des selles une sensibilité de 31,3 %. Cela signifie que le test Widal peut être utile pour exclure les cas indemnes de maladie et que les selles peuvent être utilisées pour confirmer les cas suspects.

Statistiquement, il y avait une bonne concordance (kappa = 0,33) entre la culture des selles et l’hémoculture, une mauvaise concordance (kappa = 0,01) entre le titrage Widal et la culture des selles. Des résultats similaires ont été observés dans une étude menée par Abebe et son collègue. Les résultats actuels sont en désaccord avec une étude menée à Addis-Abeba, qui a indiqué une concordance modérée (kappa = 0,41) entre le test Widal et l’hémoculture. Une autre étude menée en Éthiopie a obtenu des résultats en désaccord avec ceux de la présente étude : la concordance entre le test d’agglutination au tube de Widal (titrage) et la culture des selles était de 0,33 (kappa = 0,32), tandis que la présente étude a trouvé une très faible concordance. Cela indique que le résultat du test de Widal dans le diagnostic de la fièvre typhoïde moins probable concorde avec la culture des selles.

Nakhla et al. ont fait une étude pour trouver le test qui peut remplacer le test de Widal. Elle a comparé le test Dri-Dot d’agglutination au latex et le test de flux latéral IgM, à l’hémoculture. La sensibilité du test Dri-Dot était de 71,4 % et la spécificité de 86,3 % pour les échantillons prélevés au moment du premier diagnostic. La sensibilité et la spécificité du flux latéral d’IgM étaient respectivement de 80 % et 71,4 %, bien qu’il y ait eu une augmentation de la sensibilité à 84,3 %, mais une diminution de la spécificité à 70,5 % lorsque les deux tests rapides ont été effectués en parallèle .

Conclusion

D’après l’étude, le test de Widal a une spécificité et une VPP faibles, mais il a une sensibilité élevée et une bonne VPN avec la culture des selles. L’utilisation du seul test de Widal comme seul test de laboratoire pour le diagnostic de la fièvre typhoïde produira un mauvais diagnostic. Le test de Widal présente une faible concordance avec l’hémoculture et la coproculture ; la coproculture présente une bonne concordance avec l’hémoculture. Cela signifie que le test de Widal ne doit pas être utilisé seul mais en combinaison avec le test de l’hémoculture et de la coproculture.

La valeur élevée de la VPN signifie que le test de Widal ne peut être utile que pour connaître les personnes non malades dans la population. La faible valeur de la VPP signifiait que le test de Widal ne pouvait être utile que pour exclure les maladies de la population. La culture des selles avait une sensibilité, une spécificité et une VPP élevées, la culture des selles était plus performante que le test de Widal.