Was ist WPRE?
Das posttranskriptionale regulatorische Element (WPRE) des Woodchuck Hepatitis Virus (WHP) ist eine DNA-Sequenz, die bei der Transkription eine Tertiärstruktur erzeugt, die die Expression verstärkt. Es wird in der Molekularbiologie häufig verwendet, um die Expression von Genen zu erhöhen, die durch virale Vektoren übertragen werden. WPRE ist ein dreiteiliges regulatorisches Element mit Gamma-, Alpha- und Beta-Komponenten. Die Alphakomponente ist 80bp lang:
GCCACGGCGGAACTCATCGCCGCCTGCCTTGCCCGCTGCTGGACAGGGGCTCGGCTGTTGGCACTGACAATTCCGTGGT
Bei alleiniger Verwendung ohne die Gamma- und Beta-WPRE-Komponenten ist die Alphakomponente nur 9% so aktiv wie das vollständige dreiteilige WPRE. Die Sequenz für die vollständige dreiteilige WPRE ist wie folgt.
TCGACAATCAACCTCTGGATTACAAAATTTGTGAAAGATTGACTGGTATTCTTAACTATGTTGCTCCTTTTACGCTATGTGGATACGCTGCTTTAATGCCTTTGTA
TCATGCTATTGCTTCCCGTATGGCTTTCATTTTCTCCTCCTTGTATAAATCCTGGTTGCTGTCTCTTTATGAGGAGTTGTGGCCCGTTGTCAGGCAACGTGGCGTG
GTGTGCACTGTGTTTGCTGACGCAACCCCCACTGGTTGGGGCATTGCCACCACCTGTCAGCTCCTTTCCGGGACTTTCGCTTTCCCCCTCCCTATTGCCACGGCGG
AACTCATCGCCGCCTGCCTTGCCCGCTGCTGGACAGGGGCTCGGCTGTTGGGCACTGACAATTCCGTGGTGTTGTCGGGGAAGCTGACGTCCTTTCCATGGCTGCT
CGCCTGTGTTGCCACCTGGATTCTGCGCGGGACGTCCTTCTGCTACGTCCCTTCGGCCCTCAATCCAGCGGACCTTCCTTCCCGCGGCCTGCTGCCGGCTCTGCGG
CCTCTTCCGCGTCTTCGCCTTCGCCCTCAGACGAGTCGGATCTCCCTTTGGGCCGCCTCCCCGCCTG
Diese Sequenz hat eine 100%ige Homologie mit den Basenpaaren 1093 bis 1684 des Woodchuck Hepatitis B Virus (WHV8) Genoms. Bei Verwendung in der 3′ UTR einer Säugetier-Expressionskassette kann sie die mRNA-Stabilität und die Proteinausbeute deutlich erhöhen.