Dieses Kapitel beschreibt die Erkennung von tRNAs durch Aminoacyl-tRNA Synthetasen. Die hochspezifische Auswahl von tRNA-Substraten durch Aminoacyl-tRNA-Synthetasen ist ein faszinierendes Problem der RNA-Protein-Erkennung. Synthetasen, die für jede der 20 Aminosäuren spezifisch sind, treffen in der Zelle auf einen Pool von tRNAs mit ähnlichen Gesamtstrukturen. Die Auswahl der geeigneten tRNAs für die Bindung der einzelnen Aminosäuren erfolgt durch die Bildung von RNA-Protein-Kontakten, die für jedes kognitive tRNA-Synthetase-Paar einzigartig sind. Die Stellen in den tRNAs, die für diese Wechselwirkungen verantwortlich sind, wurden mit einer Reihe von Techniken untersucht, die in diesem Kapitel besprochen werden, wie z. B. die Tests der Aminosäure-Akzeptor-Spezifität der tRNA. Die Rolle des Anticodons bei der Erkennung, die Rolle des Akzeptorstamms und der Diskriminatorbase sowie die Rolle modifizierter Basen werden in diesem Kapitel behandelt. Das Anticodon ist für die Erkennung von tRNAAIa und möglicherweise tRNASer nicht erforderlich; diese und alle anderen tRNAs von E. coli enthalten wahrscheinlich Identitätselemente im Anticodon, die für die Unterscheidung von kognitiven und nicht kognitiven tRNAs durch Synthetasen in vivo entscheidend sind. Darüber hinaus enthalten eine Reihe von E. coli tRNAs wichtige Erkennungselemente für ihre kognitiven Synthetasen im Akzeptorstamm und/oder an der Diskriminatorstelle.