Zkoumání genomických vztahů na úrovni genů a SNP prostřednictvím analýzy obohacení, podobnosti a sítě

Hlavním cílem XGR je poskytnout systém interpretace dat. Je navržen tak, aby uživatelsky definovaný seznam genů nebo SNP byl lépe interpretovatelný díky komplexnímu využití ontologie a síťových informací k odhalení vztahů a rozšíření možností biologického objevu. XGR je jedinečný v tom, že podporuje širokou škálu ontologií (včetně znalostí biologických a molekulárních funkcí, drah, nemocí a fenotypů – u lidí i myší) a různých typů sítí (včetně funkčních, fyzických a dráhových interakcí). XGR má dvě základní funkce. První je základní infrastruktura pro snadný přístup k vestavěným ontologiím a sítím. Druhou jsou rozšiřitelné funkce, které nyní zahrnují 1) analýzu obohacení pomocí vestavěných nebo vlastních ontologií, 2) analýzu podobnosti pro výpočet sémantické podobnosti mezi geny (nebo SNP) na základě jejich ontologických anotačních profilů a 3) síťovou analýzu pro identifikaci genových sítí při zadání seznamu (významných) genů nebo SNP. Společně s webovou aplikací si XGR klade za cíl poskytnout uživatelsky přívětivý nástroj pro zkoumání genomických vztahů na úrovni genů a SNP.

.