Výzkumné centrum Woods Hole založil v roce 1985 ve Woods Hole ve státě Massachusetts George Woodwell. WHRC bylo jednou z prvních organizací zabývajících se bojem proti globálním změnám klimatu a Woodwell v roce 1986 svědčil v Kongresu o nebezpečí zvyšování hladiny moří a globálního oteplování.

Plán na vypracování Rámcové úmluvy OSN o změně klimatu vypracovali ve Woods Hole Research Center koncem 80. let Woodwell a Kilaparti Ramakrishna. V roce 2005 se jeho ředitelem stal Dr. John P. Holdren, který organizaci vedl až do svého jmenování vědeckým poradcem prezidenta Obamy v roce 2009. Holdren se do WHRC vrátil jako hlavní poradce v roce 2017 po odchodu prezidenta Obamy z funkce.

V roce 2020 bylo centrum přejmenováno na Woodwell Climate Research Center, aby se zdůraznilo vědecké zaměření na změnu klimatu a uctilo zakladatele George Woodwella.

Současným prezidentem organizace je Dr. Philip Duffy, fyzik, který byl dříve hlavním poradcem Národní rady pro vědu a technologie Bílého domu pro americký program výzkumu globální změny. Woodwell Climate má přibližně 80 zaměstnanců.

Kampus Gilman Ordway Center, který se nachází na Cape Cod ve městě Falmouth, byl dokončen v roce 2004. Budova o rozloze 19 300 čtverečních stop (1 790 m2) se skládá z renovovaného letního sídla (cca 1874) a nového křídla. Kampus je energeticky neutrální, energii z obnovitelných zdrojů vyrábí větrná turbína o výkonu 100 kW a také střešní fotovoltaické systémy.