Sievers byl souzen během Norimberského procesu s lékaři po skončení druhé světové války, kde ho novinář William L. Shirer nazval „nacistickým Modrovousem“ kvůli jeho „hustým, inkoustově černým vousům“. Ústav pro vojenský vědecký výzkum byl zřízen jako součást Ahnenerbe a obžaloba v Norimberku mu přičetla odpovědnost za pokusy na lidech, které byly prováděny pod jeho záštitou. Sievers byl jako její nejvyšší správní úředník obviněn, že zločinným pokusům aktivně napomáhal a podporoval je.

Sievers byl obviněn z členství v organizaci, kterou Mezinárodní vojenský tribunál prohlásil za zločineckou (SS), a byl zapleten do páchání válečných zločinů a zločinů proti lidskosti. Na svou obhajobu tvrdil, že již v roce 1933 byl členem protinacistického hnutí odporu, které plánovalo atentát na Hitlera a Himmlera, a že své jmenování vedoucím Ahnenerbe získal proto, aby se dostal do blízkosti Himmlera a mohl sledovat jeho pohyb. Dále tvrdil, že ve funkci zůstal na radu svého odbojového vůdce, aby shromažďoval důležité informace, které by pomohly svrhnout nacistický režim.

Sievers byl 20. srpna 1947 odsouzen k trestu smrti za zločiny proti lidskosti a 2. června 1948 oběšen ve věznici Landsberg v Bavorsku.