Během americké revoluční války bojoval William Flora pod velením plukovníka Williama Woodforda v jednotkách státu Virginie v bitvě u Great Bridge v prosinci 1775, kde je všeobecně uznáván jako hrdina této bitvy z řad patriotů. Strážný na mostě hlásil, že byl posledním, kdo přešel, když Britové postupovali vpřed. Flora ustupoval ze svého stanoviště pod těžkou palbou britské linie, když vytrhával prkna z mostu. Tím znemožnil Britům přechod pod palbou patriotů. V důsledku toho byli Britové nuceni ustoupit ke svým lodím. Jediná oběť, voják s poraněným palcem, na americké straně přežil, což velmi vypovídá o Williamu Florovi a jeho odvaze.

Podle údajů Kontinentální armády, soupisů a výplatních listin, sloužil William Flora v listopadu 1776 u „roty kapitána Williama Grymese z 15. virginského pluku“, která se zúčastnila bitev u Brandywine a Germantownu v roce 1777 a bitvy u Monmouthu v roce 1778. Se svými spolubojovníky v Jižní Karolíně se Flora vyhnul britskému zajetí při obléhání Charlestonu v roce 1780, kdy byla většina pluku zajata. Během války, protože se jednotka stále zmenšovala, byla sloučena do 11. virginského pluku a nakonec do 5. virginského pluku, a to až do konce války. Flora také bojovala v bitvě u Yorktownu v roce 1781.