TY – JOUR

T1 – Structural basis of substrate binding in WsaF, a rhamnosyltransferase from Geobacillus stearothermophilus

AU – Steiner, Kerstin

AU – Hageluken, Gregor

AU – Messner, Paul

AU – Schaeffer, Christina

AU – Naismith, James Henderson

PY – 2010/3/26

Y1 – 2010/3/26

N2 – Sacharidové polymery mají medicínský a průmyslový význam. S-vrstva mnoha grampozitivních organismů se skládá z proteinových a sacharidových polymerů a tvoří téměř parakrystalické uspořádání na povrchu buňky. Toto uspořádání je důležité nejen pro bakterie, ale má také potenciální využití při výrobě komerčně důležitých polysacharidů a glykokonjugátů. Glykan S-vrstvy glykoproteinu z Geobacillus stearothermophilus NRS 2004/3a se skládá převážně z opakujících se jednotek tří rhamnosových cukrů spojených alfa-1,3-, alfa-1,2- a beta-1,2-vazbami. Tvorba beta-1,2-vazby je katalyzována enzymem WsaF. Racionálnímu využití tohoto systému brání skutečnost, že WsaF a další enzymy v této dráze mají velmi malou homologii s jinými enzymy. Uvádíme strukturní a biochemickou charakterizaci WsaF, první charakterizované rhamnosyltransferázy tohoto typu. Strukturní práce byla podpořena metodou redukce povrchové entropie. Enzym má dvě domény, N-terminální doménu, která váže akceptor (rostoucí řetězec rhamnanu), a C-terminální doménu, která váže substrát (dTDP-beta-L-rhamnosu). Struktura WsaF navázaná na dTDP a dTDP-beta-L-rhamnose ve spojení s biochemickou analýzou identifikuje zbytky, které jsou základem katalýzy a rozpoznávání substrátu. Pomocí místně řízené mutageneze jsme zkonstruovali a otestovali model pro rozpoznávání akceptorů. (C) 2010 Elsevier Ltd. Všechna práva vyhrazena.

AB – Sacharidové polymery jsou důležité z lékařského i průmyslového hlediska. S-vrstva mnoha grampozitivních organismů se skládá z proteinových a sacharidových polymerů a tvoří na povrchu buňky téměř parakrystalické uspořádání. Toto uspořádání je důležité nejen pro bakterie, ale má také potenciální využití při výrobě komerčně důležitých polysacharidů a glykokonjugátů. Glykan S-vrstvy glykoproteinu z Geobacillus stearothermophilus NRS 2004/3a se skládá převážně z opakujících se jednotek tří rhamnosových cukrů spojených alfa-1,3-, alfa-1,2- a beta-1,2-vazbami. Tvorba beta-1,2-vazby je katalyzována enzymem WsaF. Racionálnímu využití tohoto systému brání skutečnost, že WsaF a další enzymy v této dráze mají velmi malou homologii s jinými enzymy. Uvádíme strukturní a biochemickou charakterizaci WsaF, první charakterizované rhamnosyltransferázy tohoto typu. Strukturní práce byla podpořena metodou redukce povrchové entropie. Enzym má dvě domény, N-terminální doménu, která váže akceptor (rostoucí řetězec rhamnanu), a C-terminální doménu, která váže substrát (dTDP-beta-L-rhamnosu). Struktura WsaF navázaná na dTDP a dTDP-beta-L-rhamnose ve spojení s biochemickou analýzou identifikuje zbytky, které jsou základem katalýzy a rozpoznávání substrátu. Pomocí místně řízené mutageneze jsme zkonstruovali a otestovali model rozpoznávání akceptorů. (C) 2010 Elsevier Ltd. All rights reserved.

KW – Krystalová struktura

KW – Geobacillus stearothermophilus

KW – Rhamnosyltransferasa

KW – Glykosylace bílkovin S-vrstvy

KW – Biosyntéza glykanů glykoproteinů

KW – Glykosylace bílkovin S-vrstvy

KW – Glykosylace bílkovin S-vrstvy

KW – Biosyntéza glykanů glykoproteinů Mannosyltreansferáza pima

KW – Glykogen-syntáza

KW – Difrakční data

KW – Genový klastr

KW – Glykogen-syntáza

KW – Glykogen-syntáza

KW – Glykogen-syntáza Rodina GT4

KW – Glykosyltransferázy

KW – Katalýza

KW – Sekvence

UR – http://www.scopus.com/inward/record.url?scp=77349090654&partnerID=8YFLogxK

.