Instalace (všechny počítače s Windows)

• Stáhnout WinBUGS. Rozbalte tento soubor na místo, kam jej chcete nainstalovat. To může být kdekoli, například v adresáři Program Files. Mělo by to fungovat pro jakoukoli verzi systému Windows, pro 32 nebo 64 bitů. Obsahuje klíč pro neomezené použití a byl aktualizován na verzi 1.4.3.

Snadnější instalace (pouze 32bitový systém Windows)

• Snadnější způsob instalace systému WinBUGS, který funguje pouze na 32bitových počítačích, je stažení a instalace WinBUGS14.exe.
• Poté stáhněte a nainstalujte záplatu pro verzi 1.4.3.
• Kliknutím sem získáte bezplatný klíč pro neomezené použití – lze jej použít pro více instalací.

Podpora a kontakt

Podívejte se na stránku Podpora a kontakt, kde najdete zdroje pomoci.

Obsah

• Úvod do systému WinBUGS
• Instalace systému WinBUGS 1. Nainstalujte systém WinBUGS.4 ve Windows
  • Získání klíče pro neomezené použití
  • Přechod na verzi 1.4.3
• Problémy hlášené ve WinBUGS 1.4
• Co je ještě k dispozici?

Úvod do WinBUGS

WinBUGS je součástí projektu BUGS, jehož cílem je zpřístupnit praktické metody MCMC aplikovaným statistikům. Přehled různých dostupných verzí systému BUGS naleznete na hlavní stránce BUGS.

WinBUGS může pro ovládání analýzy používat buď standardní okenní rozhraní `point-and-click`, nebo může model konstruovat pomocí grafického rozhraní zvaného DoodleBUGS. WinBUGS je samostatný program, i když jej lze volat z jiného softwaru. Verzi programu BUGS (BRugs), která je součástí statistického balíku R, naleznete na stránkách OpenBUGS.

V minulosti jsme vyžadovali, aby se u nás uživatelé zaregistrovali a získali tak neomezené možnosti použití, zejména proto, abychom měli představu o zamýšleném využití programu. Tyto informace poskytly cennou zpětnou vazbu nám i našim sponzorům. Registraci však již od uživatelů nevyžadujeme a klíč k neomezenému používání (programu WinBUGS 1.4.x) si můžete stáhnout zde.

Podívejte se na krátkou flashovou ukázku základních kroků spuštění programu WinBUGS – The Movie! (Tento film obsahuje WinBUGS 1.3 – až se na něj podíváte, pochopíte, proč WinBUGS 1.4 obsahuje skripty, abyste se vyhnuli všemu klikání a ukazování!).

Všechna dokumentace specifická pro WinBUGS je k dispozici on-line a je přibalena k programu.

Pdf verze příručky WinBUGS 1.4 (která NEOBSAHUJE funkce z patche 1.4.3) a příručky GeoBUGS (která OBSAHUJE funkce z patche 1.4.3).3 patch) si nyní můžete stáhnout, stejně jako PDF verze 1. dílu, 2. dílu a 3. dílu příkladů.

Získání souboru(ů)

Před stažením čehokoli si prosím přečtěte LICENČNÍ SMLOUVU pro WinBUGS.

Potřebné soubory jsou WinBUGS14.exe (po výběru odkazu se zobrazí dialogové okno s výzvou k uložení souboru do systému) a klíč pro neomezené použití, který je zdarma.

Pro zájemce o historické informace jsou stále k dispozici WinBUGS 1.1 a WinBUGS 1.2. Soubory WinBUGS 1.1 a WinBUGS 1.2 jsou stále k dispozici. WinBUGS 1.3 a jeho klíč jsou také k dispozici a mohou být stále užitečné v případě problémů s WinBUGS 1.4 a pro provoz PKBUGS verze 1 (viz níže).

Instalace WinBUGS 1.4 v systému Windows

Pro instalaci spusťte soubor WinBUGS14.exe. Jeden ze způsobů, jak to provést, je následující:

1. Ukončete všechny ostatní aktuálně spuštěné programy (zejména pokud používáte Windows XP)
2. Zkopírujte soubor WinBUGS14.exe do počítače
3. Přejděte do Průzkumníka a dvakrát klikněte na WinBUGS14.exe
4. Postupujte podle pokynů v dialogovém okně
5. Měli byste mít nový adresář s názvem WinBUGS14 v rámci Program Files
6. V adresáři WinBUGS14 se nachází program s názvem WinBUGS14.exe
7. Klikněte pravým tlačítkem myši na pěknou ikonu WinBUGS, vyberte možnost `vytvořit zástupce´ a přetáhněte tohoto zástupce na pracovní plochu.
8. Dvojklikem na WinBUGS14.exe spustíte WinBUGS14.

Pokud máte po instalaci problémy, zkontrolujte znovu, zda jste neměli spuštěné programy. Můžete také zkusit vypnout jakoukoli antivirovou kontrolu.

Poznámka: Zdá se, že v systému Windows Vista je problém s instalací programu WinBUGS a/nebo různých záplat. Zdá se, že Vista nemá ráda, když někdo přepisuje soubory v adresáři „C:\Program Files“ (bez ohledu na oprávnění). Proto doporučujeme instalovat WinBUGS jinam, např. do adresáře „C:\“.

Pokud vše ostatní selže (například u 64bitového počítače), můžete si stáhnout zazipovanou verzi celé struktury souborů a rozbalit ji do Program Files nebo kamkoli jinam. WinBUGS neprovádí žádné změny v registru.

Získání klíče pro neomezené použití

WinBUGS je zdarma, ale za posledních dvacet let pohltil spoustu času a peněz z grantů. Snažili jsme se, aby naši zaměstnavatelé byli spokojeni s časem stráveným na projektu tím, že jsme sledovali, kolik lidí si jej stahuje a odkud pocházejí. Bylo také velmi užitečné mít představu o tom, k čemu se používá. Tyto informace byly v minulosti shromažďovány prostřednictvím registračního procesu, kdy uživatelé zadali své údaje a e-mailem jim byl zaslán klíč k neomezenému používání softwaru (zdarma). Protože se však vývoj stále více přesouvá směrem k OpenBUGS, rozhodli jsme se, že je na čase tento registrační proces zrušit a jednoduše umožnit přímý přístup ke klíči (jehož platnost již na konci každého roku nevyprší)…

Pro stažení klíče pro neomezené používání klikněte zde. Po provedení pokynů uvedených v klíči zkontrolujte, zda byl aktualizován soubor Keys.ocf ve složce ..\WinBUGS14\Bugs\Code\. (Někteří lidé zjistili, že pro dokončení instalace klíče musí znovu spustit počítač.)

Přechod na verzi 1.4.3

K dispozici je nyní bezplatná záplata pro přechod na verzi 1.4.3. Úplný popis a soubor s opravou získáte kliknutím sem.

Některé problémy hlášené ve WinBUGS 1.4

Některé modely, které běží ve verzi 1.3, běží pomalu nebo vůbec. Dejte nám prosím k dispozici příklady. Může to být způsobeno změnou pořadí aktualizace na grafické pořadí, která vyřešila problémy s dopředným vzorkováním, ale přinesla některé nové potíže. Pravděpodobně budeme muset provést úpravy adaptivního vzorkovače řezů. (Pokud si vaše zpráva Trap stěžuje na problémy s DFreeARS (Distribution-free adaptive rejection sampling), můžete zkusit změnit vzorkování na vzorkování plátků pro logaritmicky konkávní rozdělení – návod najdete v příručce.)

Etienne Rivot upozornil, že po Trapu můžete „Uložit stavy“ (Menu modelu) a poté znovu inicializovat model s těmito stavy. Pak může být při troše štěstí užitečné správné chybové hlášení!“

Dodatky/opravy k příručce WinBUGS 1.4

• Specifikace modelu/Formátování dat: Při importu maticových dat z programu Splus verze 6 nebo vyšší pomocí příkazu `dput‘ je třeba nahradit příkazy `nrow‘ a `ncol‘ programu Splus příkazem `.Dim‘. Pořadí dimenzí zůstává stejné jako v příručce. Postup pro pole zůstává stejný jako v příručce, pouze je třeba odstranit Splusovy uvozovky a příkaz `.Dimnames‘.

• V 1.4.3 byla přidána funkce `inprod2′ – pro urychlení běhu ji použijte místo `inprod‘.

Doplňky/opravy v příručce GeoBUGS 1.2

• Syntaxe uvedená v příručce GeoBUGS pro definování měřítka mapy je chybná: V příručce se uvádí, že syntaxe je:
  xScale: 1000
  yMěřítko: 1000
  , zatímco ve skutečnosti by to mělo být
  Xscale: 1000
  : 1000
  Yscale: Co je ještě k dispozici pro WinBUGS 1.4.3?
  • GeoBUGS 1.2 pro prostorovou analýzu
  • PKBUGS pro farmakokinetické modelování
  • Nová testovací verze pro Reversible Jump MCMC.
  • Soubory funkcí S-plus/R pro diagnostiku konvergence, vhodné pro použití s jakoukoli verzí BUGS.
  • WinBUGS lze vzdáleně volat z různých balíků (i když je třeba poznamenat, že nyní lze spouštět BUGS z prostředí R pomocí BRugs).
  • V současné době máme webovou stránku určenou výhradně pro vývoj a distribuci rozšíření programu WinBUGS – více informací najdete na vývojové stránce WinBUGS a v článku Davea Lunna v bulletinu ISBA.

  Z technického hlediska používá WinBUGS softwarovou filozofii komponentově orientovaného progamování, což znamená, že program je sestaven ze sady spolupracujících komponent. Tato sada není uzavřená, a tak lze funkčnost WinBUGS průběžně rozšiřovat vývojem nových komponent: nejnovější vývoj najdete na stránkách OpenBUGS.

  Jakékoli dotazy směřujte na chyby na adrese mrc-bsu.cam.ac.uk

  .