Co je WPRE?
Posttranskripční regulační element (WPRE) viru Woodchuckovy hepatitidy (WHP) je sekvence DNA, která při transkripci vytváří terciární strukturu zvyšující expresi. Běžně se používá v molekulární biologii ke zvýšení exprese genů dodávaných virovými vektory. WPRE je trojitý regulační prvek se složkami gama, alfa a beta. Složka alfa je dlouhá 80 bp:
GCCACGGCGGAACTCATCGCCGCCTGCCTTGCCCGCTGCTGCTGGACAGGGCTCGGCTGTTGGGGCACTGACAATTCCGTGGGT
Při samostatném použití bez složek gama a beta WPRE je složka alfa pouze 9 % aktivní jako celý trojčlenný WPRE. Sekvence pro úplný tripartitní WPRE je následující.
TCGACAATCAACCTCTGGATTACAAAATTTGTGAAAGATTGACTGGTATTCTTAACTATGTTGCTCCTTTTACGCTATGTGGATACGCTGCTTTAATGCCTTTGTA
TCATGCTATTGCTTCCCGTATGGCTTTCATTTTCTCCTCCTTGTATAAATCCTGGTTGCTGTCTCTTTATGAGGAGTTGTGGCCCGTTGTCAGGCAACGTGGCGTG
GTGTGCACTGTGTTTGCTGACGCAACCCCCACTGGTTGGGGCATTGCCACCACCTGTCAGCTCCTTTCCGGGACTTTCGCTTTCCCCCTCCCTATTGCCACGGCGG
AACTCATCGCCGCCTGCCTTGCCCGCTGCTGGACAGGGGCTCGGCTGTTGGGCACTGACAATTCCGTGGTGTTGTCGGGGAAGCTGACGTCCTTTCCATGGCTGCT
CGCCTGTGTTGCCACCTGGATTCTGCGCGGGACGTCCTTCTGCTACGTCCCTTCGGCCCTCAATCCAGCGGACCTTCCTTCCCGCGGCCTGCTGCCGGCTCTGCGG
CCTCTTCCGCGTCTTCGCCTTCGCCCTCAGACGAGTCGGATCTCCCTTTGGGCCGCCTCCCCGCCTG
Tato sekvence má 100% homologii s páry bází 1093 až 1684 genomu viru hepatitidy B (WHV8) lesklokorky lesní. Při použití v 3′ UTR expresní kazety savců může výrazně zvýšit stabilitu mRNA a výtěžnost proteinu
.