Sievers a fost judecat în timpul Procesului Doctorilor de la Nürnberg, după încheierea celui de-al Doilea Război Mondial, unde a fost supranumit „Barba Albastră nazistă” de către jurnalistul William L. Shirer, din cauza „bărbii sale groase, de culoare neagră ca cerneala”. Institutul pentru Cercetare Științifică Militară fusese înființat ca parte a Ahnenerbe, iar acuzarea de la Nürnberg a imputat Ahnenerbe responsabilitatea pentru experimentele pe oameni care au fost efectuate sub auspiciile sale. Sievers, în calitate de cel mai înalt ofițer administrativ al acestuia, a fost acuzat că a ajutat și promovat în mod activ experimentele criminale.

Sievers a fost acuzat că a fost membru al unei organizații declarate criminale de către Tribunalul Militar Internațional (SS) și a fost implicat în comiterea de crime de război și crime împotriva umanității. În apărarea sa, el a susținut că, încă din 1933, a fost membru al unei mișcări de rezistență antinazistă care plănuia să îi asasineze pe Hitler și Himmler și că a obținut numirea sa ca manager al Ahnenerbe pentru a se apropia de Himmler și a-i observa mișcările. El a mai susținut că a rămas în acest post la sfatul liderului său din rezistență pentru a aduna informații vitale care să ajute la răsturnarea regimului nazist.

Sievers a fost condamnat la moarte la 20 august 1947 pentru crime împotriva umanității și spânzurat la 2 iunie 1948, la închisoarea Landsberg din Bavaria.

.