Acest capitol descrie recunoașterea ARNt de către aminoacil-ARNt sintetazele. Selecția extrem de specifică a substraturilor ARNt de către aminoacil-ARNt sintetazele reprezintă o problemă intrigantă în recunoașterea ARN-proteină. Sintetazele specifice pentru fiecare dintre cei 20 de aminoacizi întâlnesc în celulă un grup de ARNt cu structuri generale similare. Selectarea ARNt adecvat pentru atașarea fiecărui aminoacid are loc prin formarea unor contacte ARN-proteină unice pentru fiecare pereche ARNt-sintetază cognată. Locurile din ARNt care guvernează aceste interacțiuni au fost cercetate printr-o varietate de tehnici discutate în acest capitol, cum ar fi testele de specificitate amino-acid-acceptor al ARNt. Rolul anticodonului în recunoaștere, rolul tulpinii acceptoare și al bazei discriminatoare, precum și rolul bazelor modificate sunt discutate în acest capitol. Anticodonul nu este necesar pentru recunoașterea tRNAAIa și, posibil, a tRNASer; acestea și toate celelalte tRNA-uri din E. coli conțin probabil elemente de identitate în anticodon care sunt cruciale pentru discriminarea tRNA-urilor cognate și necunoscute de către sintetaze in vivo. În plus, un număr de ARNt din E. coli conțin elemente importante de recunoaștere pentru sintetazele lor cognate în tulpina acceptoare și/sau în situsul discriminator.

.