Articles

Baza structurală a legării substratului în WsaF, o rhamnosiltransferază de la Geobacillus stearothermophilus – University of St Andrews

TY – JOUR

T1 – Baza structurală a legării substratului în WsaF, o rhamnosiltransferază de la Geobacillus stearothermophilus

AU – Steiner, Kerstin

AU – Hageluken, Gregor

AU – Messner, Paul

AU – Schaeffer, Christina

AU – Naismith, James Henderson

PY – 2010/3/26

Y1 – 2010/3/26

N2 – Carbohydrate polymers are medically and industrially important. Stratul S al multor organisme Gram-pozitive cuprinde polimeri de proteine și carbohidrați și formează o matrice aproape paracristalină pe suprafața celulară. Nu numai că această matrice este importantă pentru bacterii, dar are, de asemenea, aplicații potențiale în fabricarea de polizaharide și glicoconjugate importante din punct de vedere comercial. Glicanul glicoproteinei stratului S de la Geobacillus stearothermophilus NRS 2004/3a este compus în principal din unități repetitive de trei zaharuri ramnoză legate prin legături alfa-1,3, alfa-1,2 și beta-1,2. Formarea legăturii beta-1,2 este catalizată de enzima WsaF. Utilizarea rațională a acestui sistem este îngreunată de faptul că WsaF și alte enzime din această cale au foarte puțină homologie cu alte enzime. Raportăm caracterizarea structurală și biochimică a WsaF, prima astfel de ramnosiltransferază care a fost caracterizată. Activitatea structurală a fost facilitată de metoda reducerii entropiei de suprafață. Enzima are două domenii, domeniul N-terminal, care se leagă de acceptor (lanțul ramnanic în creștere), și domeniul C-terminal, care se leagă de substrat (dTDP-beta-L-ramnoză). Structura WsaF legată de dTDP și dTDP-beta-L-ramnoză, împreună cu analiza biochimică, identifică reziduurile care stau la baza catalizei și a recunoașterii substratului. Am construit și testat prin mutageneză dirijată de situs un model pentru recunoașterea acceptorului. (C) 2010 Elsevier Ltd. Toate drepturile rezervate.

AB – Polimerii carbohidrați sunt importanți din punct de vedere medical și industrial. Stratul S al multor organisme Gram-pozitive cuprinde polimeri de proteine și carbohidrați și formează o matrice aproape paracristalină pe suprafața celulară. Nu numai că această matrice este importantă pentru bacterii, dar are, de asemenea, aplicații potențiale în fabricarea de polizaharide și glicoconjugate importante din punct de vedere comercial. Glicanul glicoproteinei stratului S de la Geobacillus stearothermophilus NRS 2004/3a este compus în principal din unități repetitive de trei zaharuri ramnoză legate prin legături alfa-1,3, alfa-1,2 și beta-1,2. Formarea legăturii beta-1,2 este catalizată de enzima WsaF. Utilizarea rațională a acestui sistem este îngreunată de faptul că WsaF și alte enzime din această cale au foarte puțină homologie cu alte enzime. Raportăm caracterizarea structurală și biochimică a WsaF, prima astfel de ramnosiltransferază care a fost caracterizată. Activitatea structurală a fost facilitată de metoda reducerii entropiei de suprafață. Enzima are două domenii, domeniul N-terminal, care se leagă de acceptor (lanțul ramnanic în creștere), și domeniul C-terminal, care se leagă de substrat (dTDP-beta-L-ramnoză). Structura WsaF legată de dTDP și dTDP-beta-L-ramnoză, împreună cu analiza biochimică, identifică reziduurile care stau la baza catalizei și a recunoașterii substratului. Am construit și testat prin mutageneză dirijată de situs un model pentru recunoașterea acceptorului. (C) 2010 Elsevier Ltd. All rights reserved.

KW – Structură cristalină

KW – Geobacillus stearothermophilus

KW – Rhamnosiltransferaza

KW – Glicozilarea proteinelor din stratul S

KW – Biosinteza glicanului glicanic al glicoproteinei

KW – Glicozilarea proteinelor din stratul S

KW – Biosinteza glicanicelor din stratul S Mannosiltreansferaza pima

KW – Glicogen-sintetaza

KW – Date de difracție

KW – Gene-cluster

KW – Gene-cluster

KW – Familia GT4

KW – Glicoziltransferaze

KW – Cataliză

KW – Secvență

UR – http://www.scopus.com/inward/record.url?scp=77349090654&partnerID=8YFLogxK

.