Explorar as Relações Genômicas no Nível Gene e SNP através do Enriquecimento, Similaridade e Análise de Rede

O objetivo central do XGR é fornecer um sistema de interpretação de dados. Ele é projetado para tornar um gene ou lista SNP mais interpretável através da utilização abrangente de ontologia e informações de rede para revelar relações e aumentar as oportunidades de descoberta biológica. XGR é único em suportar uma ampla gama de ontologias (incluindo conhecimento de funções biológicas e moleculares, caminhos, doenças e fenótipos – tanto em humanos como em ratos) e diferentes tipos de redes (incluindo interacções funcionais, físicas e de caminhos). Existem duas funcionalidades centrais do XGR. A primeira é a infra-estrutura básica para fácil acesso a ontologias e redes incorporadas. A segunda são funções extensíveis, agora incluindo 1) análise de enriquecimento usando ontologias embutidas ou personalizadas, 2) análise de similaridade para calcular a similaridade semântica entre genes (ou SNPs) com base em seus perfis de anotação ontológica, e 3) análise de rede para identificação de redes de genes dada uma lista de consulta de genes (significativos) ou SNPs. Juntamente com sua aplicação web, XGR visa fornecer uma ferramenta amigável para explorar as relações genômicas ao nível do gene e SNP.