Este capítulo descreve o reconhecimento de tRNAs por aminoacyl-tRNA synthetases. A seleção altamente específica de substratos de tRNA por sínteses de aminoacil-tRNA é um problema intrigante no reconhecimento de proteínas de RNA. As sínteses específicas para cada um dos 20 aminoácidos encontram um pool de tRNAs na célula com estruturas gerais similares. A seleção dos tRNAs apropriados para a fixação de cada aminoácido ocorre pela formação de contatos RNA-proteína únicos para cada par cognato de tRNA-sintetase. Os locais em tRNAs que governam essas interações têm sido investigados por uma variedade de técnicas discutidas no capítulo, tais como os ensaios da especificidade amino-ácido-aceitador do tRNA. O papel do anticodonte no reconhecimento, papel do tronco aceitador e base discriminadora, e papel das bases modificadas é discutido no capítulo. O anticodonte não é necessário para o reconhecimento dos tRNAAIa, e possivelmente do tRNASer; estes e todos os outros E. coli tRNAs provavelmente contêm elementos de identidade no anticodonte que são cruciais para a discriminação dos tRNAs cognatos e não-cognatos por sínteses in vivo. Além disso, uma série de E. coli tRNAs contém elementos importantes de reconhecimento para as suas sínteses cognatas no tronco do aceitador e/ou no local do discriminador.