O que é WPRE?
Woodchuck Hepatitis Virus (WHP) Posttranscriptional Regulatory Element (WPRE) é uma sequência de ADN que, quando transcrita, cria uma estrutura terciária melhorando a expressão. Comumente usado em biologia molecular para aumentar a expressão de genes fornecidos por vetores virais. O WPRE é um elemento regulador tripartido com componentes gama, alfa e beta. O componente alfa tem 80bp de comprimento:
GCCACGGCGGAACTCATCGCCGCCTGCCTTGCCCGCTGCTGGACAGGGGCTCGCTGCTGTTGGGGGCACTGACAATTCCGTGGGT
Quando usado sozinho sem os componentes gama e beta WPRE o componente alfa é apenas 9% tão ativo quanto o WPRE tripartido completo. A sequência para o WPRE tripartido completo é tão tola quanto a WPRE.
TCGACAATCAACCTCTGGATTACAAAATTTGTGAAAGATTGACTGGTATTCTTAACTATGTTGCTCCTTTTACGCTATGTGGATACGCTGCTTTAATGCCTTTGTA
TCATGCTATTGCTTCCCGTATGGCTTTCATTTTCTCCTCCTTGTATAAATCCTGGTTGCTGTCTCTTTATGAGGAGTTGTGGCCCGTTGTCAGGCAACGTGGCGTG
GTGTGCACTGTGTTTGCTGACGCAACCCCCACTGGTTGGGGCATTGCCACCACCTGTCAGCTCCTTTCCGGGACTTTCGCTTTCCCCCTCCCTATTGCCACGGCGG
AACTCATCGCCGCCTGCCTTGCCCGCTGCTGGACAGGGGCTCGGCTGTTGGGCACTGACAATTCCGTGGTGTTGTCGGGGAAGCTGACGTCCTTTCCATGGCTGCT
CGCCTGTGTTGCCACCTGGATTCTGCGCGGGACGTCCTTCTGCTACGTCCCTTCGGCCCTCAATCCAGCGGACCTTCCTTCCCGCGGCCTGCTGCCGGCTCTGCGG
CCTCTTCCGCGTCTTCGCCTTCGCCCTCAGACGAGTCGGATCTCCCTTTGGGCCGCCTCCCCGCCTG
Esta sequência tem 100% homologia com pares de bases 1093 a 1684 do genoma do vírus da hepatite B do Woodchuck (WHV8). Quando usado na cassete de expressão de um mamífero 3′ pode aumentar significativamente a estabilidade do mRNA e a produção de proteínas.