In twee onderzoeksfasen (2003 en 2008) zijn organische, nutriënten- en zoutverontreinigingsparameters onderzocht in de benedenloop van de Werra om het belang van deze verschillende soorten verontreiniging voor de kwaliteitscomponent van macro-ongewervelden in te schatten overeenkomstig de Europese Kaderrichtlijn Water. Het chemisch en biologisch onderzoek is uitgevoerd door een “referentie”-gedeelte zonder zoutverontreiniging te vergelijken met het met zout verontreinigde gedeelte als gevolg van de potasmijnbouw van Vacha tot Hannoversch Münden dicht bij de monding van de Werra. Uit de resultaten blijkt dat de drastische verschillen tussen de macroinvertebraten van de Werra stroomopwaarts en stroomafwaarts van de met zout verontreinigde gedeelten duidelijk veroorzaakt worden door de zoutbelasting. De andere soorten chemische invloeden zijn niet verantwoordelijk voor de waargenomen fundamentele verandering in de samenstelling van het benthische ongewervelde dierenbestand. De algemene verslechtering van de morfologie van de beek, aangegeven door macro-ongewervelden, laat een goede ecologische toestand zien voor het niet met zout verontreinigde deel van de rivier en een slechte toestand voor de met zout verontreinigde delen van de benedenloop van de Werra.