Als minder belangrijk bijkomend mineraal komt xenotime voor in pegmatieten en andere stollingsgesteenten, alsook in gneizen die rijk zijn aan mica en kwarts. Geassocieerde mineralen zijn biotiet en andere mica’s, mineralen uit de chlorietgroep, kwarts, zirkoon, bepaalde veldspaten, analcime, anatase, brookiet, rutiel, sideriet en apatiet. Xenotime is ook bekend als diagenetisch: het kan zich vormen als minuscule korrels of als uiterst dunne (minder dan 10 µ) deklagen op detritale zirkoonkorrels in siliciclastische sedimentgesteenten. Het belang van deze diagenetische xenotime-afzettingen voor de radiometrische datering van sedimentaire gesteenten begint zich nu pas te realiseren.

De in 1824 ontdekte xenotime heeft als type-localiteit Hidra (Hitterø), Flekkefjord, Vest-Agder, Noorwegen. Andere opmerkelijke vindplaatsen zijn: Arendal en Tvedestrand, Noorwegen; Novo Horizonte, São Paulo, Novo Horizonte, Bahia en Minas Gerais, Brazilië; Madagaskar en Californië, Colorado, Georgia, North Carolina en New Hampshire, Verenigde Staten. Een nieuwe ontdekking van gemmy, van kleur veranderend (bruinachtig tot geel) xenotime is gemeld uit Afghanistan en is gevonden in Pakistan. Ten noorden van de berg Funabuse in de prefectuur Gifu, Japan, wordt op een heuvel met de naam Maru-Yama een opmerkelijk basaltgesteente ontgonnen: kristallen van xenotime en zirkoon, gerangschikt in een stralend, bloemvormig patroon, zijn zichtbaar in gepolijste plakjes van het gesteente, dat bekend staat als chrysantgesteente (vertaald uit het Japans 菊石 kiku-ishi). Deze steen wordt in Japan alom gewaardeerd om zijn sierwaarde.

Kleine tonnages xenotimezand worden gewonnen in verband met Maleisische tinwinning, enz. en worden commercieel verwerkt. Het gehalte aan lanthaniden is typisch voor “yttriumaarde”-mineralen en bedraagt ongeveer tweederde yttrium, terwijl de rest voornamelijk bestaat uit de zware lanthaniden, waarbij de even genummerde lanthaniden (zoals Gd, Dy, Er, of Yb) elk ongeveer op 5%-niveau aanwezig zijn, en de oneven genummerde lanthaniden (zoals Tb, Ho, Tm, Lu) elk op ongeveer 1%-niveau aanwezig zijn. Dysprosium is gewoonlijk de meest overvloedige van de even genummerde zwaargewichten, en holmium is de meest overvloedige van de oneven genummerde zwaargewichten. De lichtste lanthaniden zijn over het algemeen beter vertegenwoordigd in monaziet, terwijl de zwaarste lanthaniden in xenotime zitten.