Articles

Wat is WPRE?

Woodchuck Hepatitis Virus (WHP) Posttranscriptional Regulatory Element (WPRE) is een DNA-sequentie die, wanneer getranscribeerd, een tertiaire structuur creëert die de expressie bevordert. Het wordt vaak gebruikt in de moleculaire biologie om de expressie te verhogen van genen die door virale vectoren worden geleverd. WPRE is een drieledig regulerend element met gamma-, alfa- en bètacomponenten. De alfa component is 80 bp lang:

GCCACGGCGGAACTCATCGCCGCCTGCCTTGCCCGCTGCTGACAGGGGCTCCTGTTGGGCACTGACAATTCCGTGGT

Wanneer alleen gebruikt zonder de gamma en beta WPRE componenten is de alfa component slechts 9% zo actief als de volledige tripartiete WPRE. De volgorde voor volledig drievoudig WPRE is als volgt.
TCGACAATCAACCTCTGGATTACAAAATTTGTGAAAGATTGACTGGTATTCTTAACTATGTTGCTCCTTTTACGCTATGTGGATACGCTGCTTTAATGCCTTTGTA
TCATGCTATTGCTTCCCGTATGGCTTTCATTTTCTCCTCCTTGTATAAATCCTGGTTGCTGTCTCTTTATGAGGAGTTGTGGCCCGTTGTCAGGCAACGTGGCGTG
GTGTGCACTGTGTTTGCTGACGCAACCCCCACTGGTTGGGGCATTGCCACCACCTGTCAGCTCCTTTCCGGGACTTTCGCTTTCCCCCTCCCTATTGCCACGGCGG
AACTCATCGCCGCCTGCCTTGCCCGCTGCTGGACAGGGGCTCGGCTGTTGGGCACTGACAATTCCGTGGTGTTGTCGGGGAAGCTGACGTCCTTTCCATGGCTGCT
CGCCTGTGTTGCCACCTGGATTCTGCGCGGGACGTCCTTCTGCTACGTCCCTTCGGCCCTCAATCCAGCGGACCTTCCTTCCCGCGGCCTGCTGCCGGCTCTGCGG
CCTCTTCCGCGTCTTCGCCTTCGCCCTCAGACGAGTCGGATCTCCCTTTGGGCCGCCTCCCCGCCTG

Deze sequentie heeft 100% homologie met de basenparen 1093 tot 1684 van het genoom van het Woodchuck hepatitis B-virus (WHV8). Wanneer gebruikt in de 3′ UTR van een zoogdier-expressiecassette kan het de mRNA-stabiliteit en eiwitopbrengst aanzienlijk verhogen.