Xiphophorus Genetic Stock Center
Dr. Manfred Schartl
Mes principaux intérêts de recherche sont les processus moléculaires dans le développement organismique et leur dysfonctionnement dans la cancérogenèse. Un sujet majeur est la transduction du signal et la régulation des gènes dans le mélanome. J’utilise le système modèle Xiphophorus et des medaka transgéniques qui développent différents types de tumeurs des cellules pigmentaires. Outre les outils classiques de caractérisation biochimique de la transduction du signal et de la régulation transcriptionnelle, j’utilise le séquençage du génome et la transcriptomique RNA-Seq dans une approche comparative des modèles de poissons avec des données humaines pour identifier de nouveaux gènes de mélanome et de petits ARN non codants qui sont impliqués dans la transition d’une lésion pigmentaire bénigne vers un mélanome malin. Pour les études fonctionnelles, nous avons mis en place différents systèmes de culture cellulaire à partir de mélanomes de poissons, de souris et d’humains pour mesurer les lectures de paramètres uniques de transformation maligne. Ces études sont complétées par des études sur des poissons transgéniques et des poissons knock-out CRISPR/Cas9. Mon équipe a été pionnière dans l’utilisation de modèles de petits poissons d’aquarium pour la recherche sur le cancer. Après avoir isolé le premier oncogène du mélanome à partir d’un organisme modèle, nos recherches ont mis en évidence l’importance de la signalisation Ras/Raf/MAPK pour la formation du mélanome, qui est aujourd’hui reconnue comme responsable de plus de 60 % des mélanomes humains. Bien que mes recherches soient ancrées dans la science fondamentale pour comprendre les bases génétiques, moléculaires et cellulaires de la formation du cancer, j’ai toujours porté une attention particulière à l’aspect translationnel de mes résultats. J’ai mis en place des équipes de professeurs adjoints et associés à ma chaire qui travaillent sur des modèles de souris et des lignées de cellules cancéreuses humaines et j’ai fréquemment collaboré avec des scientifiques cliniciens. Les études comparatives ont abouti à la caractérisation de molécules et de processus cellulaires détectés pour la première fois dans des modèles de poissons et qui s’avèrent pertinents pour le diagnostic et la thérapie de la maladie humaine. À la faculté de médecine de mon université, j’ai lancé l’utilisation du séquençage de nouvelle génération pour le diagnostic des patients atteints de cancer. J’ai développé avec mes collègues de dermatologie un diagnostic génétique par séquençage ciblé pour les patients atteints de mélanome, qui est maintenant adapté aux nouveaux développements technologiques. Ce programme a connu un tel succès que d’autres unités cliniques du Comprehensive Cancer Center ont rapidement adopté cette méthodologie pour leurs patients. Dans le cadre de notre projet financé par le NIH avec mes collègues de l’Université d’État du Texas, j’ai mis au point un nouveau système de dépistage basé sur les modifications du transcriptome dans les mélanomes développant des poissons pour la détection de médicaments anticancéreux à partir de tests à haut débit de bibliothèques chimiques.
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