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Qu’est-ce que le WPRE?

L’élément de régulation post-transcriptionnel (WPRE) du virus de l’hépatite de Woodchuck (WHP) est une séquence d’ADN qui, lorsqu’elle est transcrite, crée une structure tertiaire améliorant l’expression. Il est couramment utilisé en biologie moléculaire pour augmenter l’expression des gènes délivrés par des vecteurs viraux. Le WPRE est un élément régulateur tripartite avec des composants gamma, alpha et bêta. Le composant alpha est long de 80bp:

GCCACGGCGGAACTCATCGCCGCCTTGCCCGCTGCTGGACAGGGGCTCGGCTGTTGGGCACTGACAATTCCGTGGT

Lorsqu’il est utilisé seul sans les composants gamma et bêta du WPRE, le composant alpha est seulement 9% aussi actif que le WPRE tripartite complet. La séquence pour la WPRE tripartite complète est la suivante.
TCGACAATCAACCTCTGGATTACAAAATTTGTGAAAGATTGACTGGTATTCTTAACTATGTTGCTCCTTTTACGCTATGTGGATACGCTGCTTTAATGCCTTTGTA
TCATGCTATTGCTTCCCGTATGGCTTTCATTTTCTCCTCCTTGTATAAATCCTGGTTGCTGTCTCTTTATGAGGAGTTGTGGCCCGTTGTCAGGCAACGTGGCGTG
GTGTGCACTGTGTTTGCTGACGCAACCCCCACTGGTTGGGGCATTGCCACCACCTGTCAGCTCCTTTCCGGGACTTTCGCTTTCCCCCTCCCTATTGCCACGGCGG
AACTCATCGCCGCCTGCCTTGCCCGCTGCTGGACAGGGGCTCGGCTGTTGGGCACTGACAATTCCGTGGTGTTGTCGGGGAAGCTGACGTCCTTTCCATGGCTGCT
CGCCTGTGTTGCCACCTGGATTCTGCGCGGGACGTCCTTCTGCTACGTCCCTTCGGCCCTCAATCCAGCGGACCTTCCTTCCCGCGGCCTGCTGCCGGCTCTGCGG
CCTCTTCCGCGTCTTCGCCTTCGCCCTCAGACGAGTCGGATCTCCCTTTGGGCCGCCTCCCCGCCTG

Cette séquence présente une homologie de 100% avec les paires de bases 1093 à 1684 du génome du virus de l’hépatite B de Woodchuck (WHV8). Lorsqu’elle est utilisée dans le 3′ UTR d’une cassette d’expression de mammifère, elle peut augmenter significativement la stabilité de l’ARNm et le rendement protéique.