El genoma humano no contiene los genes que codifican la degradación del xiloglucano a pesar de que los xiloglucanos son un componente importante de la mayoría de las dietas humanas. Estudios recientes han demostrado que un locus genético discreto confiere el metabolismo del xiloglucano en Bacteroidetes seleccionados del intestino humano. Este hallazgo revela que el metabolismo incluso de componentes muy abundantes de la fibra dietética puede estar mediado por especies de nicho. El metabolismo de los xiloglucanos es el resultado de la acción concertada de varias enzimas y transportadores de membrana. Sin embargo, dada la gran diversidad de composición de los xiloglucanos de diferentes fuentes vegetales, existe una enzima clave, una endoxiloglucanasa llamada BoGH5A, que tiene la capacidad de escindir una serie de xiloglucanos para generar xiloglucanos cortos listos para su absorción. Un análisis detallado de la estructura y la función de la enzima ha revelado la presencia de un dominio denominado dominio BACON cuya función principal en BoGH5A puede ser la de distanciar el módulo catalítico de la superficie celular y conferir movilidad adicional al dominio catalítico para atacar el polisacárido. Una amplia hendidura en el sitio activo que genera plasticidad de unión es la característica clave que permite a BoGH5A acomodar una amplia gama de XyGs naturales.

La prevalencia de XyGs en la dieta humana sugiere que el mecanismo por el que las bacterias degradan estos polisacáridos complejos es muy importante para la adquisición de energía por parte del ser humano. Además, la rareza del metabolismo de los XyGs pone de manifiesto la importancia de Bacteroides ovatus y otros Bacteroidetes que degradan XyGs como miembros clave del consorcio microbiano del intestino humano.