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Reconocimiento de †ARNs por aminoacil-†ARN sintetasas

Este capítulo describe el reconocimiento de tRNAs por aminoacil-ARN sintetasas. La selección altamente específica de sustratos de ARNt por parte de las aminoacil-ARNt sintetasas es un problema intrigante en el reconocimiento ARN-proteína. Las sintetasas específicas para cada uno de los 20 aminoácidos encuentran en la célula un conjunto de ARNt con estructuras generales similares. La selección de los ARNt apropiados para la unión de cada aminoácido se produce mediante la formación de contactos ARN-proteína únicos para cada par ARNt-sintetasa afín. Los sitios en los ARNt que gobiernan estas interacciones han sido investigados por una variedad de técnicas discutidas en el capítulo, como los ensayos de la especificidad aminoácido-aceptante del ARNt. El papel del anticodón en el reconocimiento, el papel del tallo aceptor y la base discriminante, y el papel de las bases modificadas se discuten en el capítulo. El anticodón no se requiere para el reconocimiento de tRNAAIa, y posiblemente tRNASer; estos y todos los otros tRNAs de E. coli probablemente contienen elementos de identidad en el anticodón que son cruciales para la discriminación de tRNAs cognados y no reconocidos por las sintetasas in vivo. Además, un número de E. coli tRNAs contiene los elementos del reconocimiento importantes para sus sintetasas cognadas en el tallo del aceptor y/o en el sitio del discriminador.