¿Qué es el WPRE?
El elemento regulador postranscripcional (WPRE) del virus de la hepatitis de Woodchuck (WHP) es una secuencia de ADN que, cuando se transcribe, crea una estructura terciaria que mejora la expresión. Se utiliza comúnmente en biología molecular para aumentar la expresión de los genes suministrados por vectores virales. El WPRE es un elemento regulador tripartito con componentes gamma, alfa y beta. El componente alfa tiene una longitud de 80 pb:
GCCACGGCGAACTCCGCCGCCTGCCTTGCCCGCTGACGGGCTCGCTGTTGGCACTGACAATTCCGTGGT
Cuando se utiliza solo, sin los componentes gamma y beta del WPRE, el componente alfa sólo es un 9% tan activo como el WPRE tripartito completo. La secuencia del WPRE tripartito completo es la siguiente.
TCGACAATCAACCTCTGGATTACAAAATTTGTGAAAGATTGACTGGTATTCTTAACTATGTTGCTCCTTTTACGCTATGTGGATACGCTGCTTTAATGCCTTTGTA
TCATGCTATTGCTTCCCGTATGGCTTTCATTTTCTCCTCCTTGTATAAATCCTGGTTGCTGTCTCTTTATGAGGAGTTGTGGCCCGTTGTCAGGCAACGTGGCGTG
GTGTGCACTGTGTTTGCTGACGCAACCCCCACTGGTTGGGGCATTGCCACCACCTGTCAGCTCCTTTCCGGGACTTTCGCTTTCCCCCTCCCTATTGCCACGGCGG
AACTCATCGCCGCCTGCCTTGCCCGCTGCTGGACAGGGGCTCGGCTGTTGGGCACTGACAATTCCGTGGTGTTGTCGGGGAAGCTGACGTCCTTTCCATGGCTGCT
CGCCTGTGTTGCCACCTGGATTCTGCGCGGGACGTCCTTCTGCTACGTCCCTTCGGCCCTCAATCCAGCGGACCTTCCTTCCCGCGGCCTGCTGCCGGCTCTGCGG
CCTCTTCCGCGTCTTCGCCTTCGCCCTCAGACGAGTCGGATCTCCCTTTGGGCCGCCTCCCCGCCTG
Esta secuencia tiene un 100% de homología con los pares de bases 1093 a 1684 del genoma del virus de la hepatitis B de Woodchuck (WHV8). Cuando se utiliza en la 3′ UTR de un casete de expresión de mamíferos puede aumentar significativamente la estabilidad del ARNm y el rendimiento proteico.